{"id":188506,"date":"2014-12-29T16:16:13","date_gmt":"2014-12-29T18:16:13","guid":{"rendered":"http:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/?p=188506"},"modified":"2015-06-26T16:22:05","modified_gmt":"2015-06-26T19:22:05","slug":"la-multiplicacion-de-los-blancos","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/la-multiplicacion-de-los-blancos\/","title":{"rendered":"La multiplicaci\u00f3n de los blancos"},"content":{"rendered":"
\"El

Neoprospecta<\/span>El laboratorio de Neoprospecta: secuenciaci\u00f3n de microorganismos e identificaci\u00f3n…Neoprospecta<\/span><\/p><\/div>\n

De acuerdo con datos de la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud (OMS), el 14% de los pacientes internados en todo el mundo sufre de infecciones hospitalarias. Seg\u00fan la Asociaci\u00f3n Nacional de Bioseguridad (ANBio), solamente en Brasil, mueren 100 mil personas todos los a\u00f1os por contaminaciones adquiridas en hospitales y cl\u00ednicas donde acudieron en busca de tratamiento para otras enfermedades. Una de las dificultades en el control de las infecciones es la demora en la identificaci\u00f3n de los microorganismos dentro de los hospitales. Este problema condujo a dos doctorandos en gen\u00e9tica y biolog\u00eda molecular de la Universidad Federal de Rio Grande do Sul (UFRGS) al desarrollo de una tecnolog\u00eda que analiza hasta 512 muestras e identifica, en cada una de ellas, decenas de miles de especies de microorganismos, en un plazo de tres a cinco d\u00edas en promedio, que es un tiempo similar al que insume la detecci\u00f3n de tan s\u00f3lo una bacteria mediante el m\u00e9todo tradicional. Los doctorandos, el farmac\u00e9utico Marcos de Oliveira Carvalho y el bi\u00f3logo Luiz Felipe Valter de Oliveira, fundaron la peque\u00f1a empresa Neoprospecta, en el Sapiens Parque, en Florian\u00f3polis, estado de Santa Catarina.<\/p>\n

La t\u00e9cnica antigua de detecci\u00f3n de bacterias, que todav\u00eda es la m\u00e1s empleada, se vale de placas de Petri, en las cuales se cultivan las especies y se identifican una por una. El problema radica en que el cultivo de cada bacteria puede demorar hasta una semana. La tecnolog\u00eda de Neoprospecta asocia an\u00e1lisis de ADN con un algoritmo \u2012instrucciones matem\u00e1ticas para un software<\/em>\u2012 que automatiza todo el proceso. \u201cSe trata de una plataforma que abarca varias etapas, tecnolog\u00edas y sistemas\u201d, dice Carvalho, presidente del directorio de la empresa. Todo el proceso se realiza en cuatro etapas: recolecci\u00f3n del material en varios puntos del hospital \u2012u otras instituciones y empresas tales como cl\u00ednicas, centros de salud, f\u00e1bricas de alimentos y estaciones de tratamiento de agua\u2012, secuenciaci\u00f3n del genoma, an\u00e1lisis de los datos y presentaci\u00f3n de los resultados.<\/p>\n

La colecta se realiza en puntos posiblemente contaminados, incluyendo las manos, chaquetas e instrumental de los profesionales de la instituci\u00f3n (m\u00e9dicos, enfermeras, auxiliares), artefactos de uso invasivo, salas, galer\u00edas, bebederos, puertas, picaportes, camas e incluso entre los propios pacientes. \u201cPara ello empleamos, en cada muestra, instrumentos similares a hisopos, en este caso mayores, de hasta 15 cent\u00edmetros, denominados swab<\/em>\u201d, explica Carvalho. \u201cEn su extremo, \u00e9stos tiene una c\u00e1psula que contiene un l\u00edquido denominado soluci\u00f3n de lise<\/em> y una v\u00e1lvula de pl\u00e1stico, por donde esa soluci\u00f3n entra en contacto con el material recogido\u201d. Esa soluci\u00f3n est\u00e1 compuesta por una mezcla de agua, detergente y cloruro de sodio, m\u00e1s conocido como sal de cocina, que se utiliza para romper la membrana celular. \u201cAs\u00ed, la rotura de las c\u00e9lulas de las bacterias se inicia en el propio swab<\/em>, lo cual brinda mayor seguridad en el transporte del material, comenzando el proceso de purificaci\u00f3n del ADN\u201d, dice Carvalho. \u201cSon cientos de swab<\/em> los que se emplean en el an\u00e1lisis de un hospital. Luego de la recolecci\u00f3n, se los coloca en cajas especiales, dise\u00f1adas por nosotros, que se env\u00edan a nuestro laboratorio, donde el ADN de los microorganismos es purificado. Hasta ese punto, el material gen\u00e9tico de todas las especies presentes en las muestras recogidas se encuentra mezclado\u201d.<\/p>\n

\"...de

Neoprospecta<\/span>…de la especie y de la cantidad de bacterias relacionadas con el lugar de donde se tom\u00f3 la muestraNeoprospecta<\/span><\/p><\/div>\n

La etapa siguiente es la secuenciaci\u00f3n. Pero, para eso, previamente se realiza una preparaci\u00f3n de esa \u201csopa\u201d de ADN purificado con cientos o miles de especies de bacterias. \u201cEsa t\u00e9cnica de preparaci\u00f3n fue desarrollada y perfeccionada en nuestra empresa y nos permite ampliar el multiplexado de las muestras sin p\u00e9rdida de calidad\u201d, explica Carvalho. \u201cDe este modo, analizamos m\u00faltiples muestras simult\u00e1neamente, logrando hacerlo con mayor rapidez y menor costo\u201d. Seg\u00fan informa, el costo del cultivo de una bacteria es de unos 100 reales. Cada swab<\/em> cuesta alrededor de 150 reales, pero puede identificar cientos y hasta miles de especies, lo cual reduce a centavos el gasto en la identificaci\u00f3n de cada bacteria. En el an\u00e1lisis de los datos de la secuenciaci\u00f3n \u2012que llegan a decenas de gigabytes\u2012, el ADN, que todav\u00eda se encuentra mezclado, se separa por especies. De este modo, ser\u00e1 posible identificar cu\u00e1ntos existen en la muestra y la cantidad de bacterias. \u201cEn esa etapa, se someten los datos a otros algoritmos, que los individualizan por especie y los catalogan\u201d, explica Carvalho. \u201cTodo el proceso se realiza en servidores que pertenecen a Neoprospecta, en los cuales se codifican y tratan los datos bajo un r\u00e9gimen de alta seguridad\u201d.<\/p>\n

Para identificar cada especie de microorganismo, el algoritmo compara el ADN de las bacterias secuenciadas en la muestra con el de miles de millones que integran un banco de datos de la empresa. A pesar de ese gran n\u00famero catalogado, hasta un 50% de los que se identifican en un hospital se encuentra fuera del banco de datos, y muchos de ellos incluso son desconocidos por la ciencia. Cuando eso ocurre, las nuevas bacterias son etiquetadas y pasan a formar parte del mismo. El trabajo de clasificarlas lo har\u00e1n otros investigadores del \u00e1rea de taxonom\u00eda, por ejemplo.<\/p>\n

Inversi\u00f3n acelerada
\n<\/strong>La \u00faltima fase es la presentaci\u00f3n de los resultados. \u201cPara ello, se ingresan los datos en un sistema que desarrollamos para el an\u00e1lisis del riesgo microbiol\u00f3gico y el control de calidad del ambiente hospitalario\u201d, explica Carvalho. \u201cEste sistema presenta una visualizaci\u00f3n de la carga microbiol\u00f3gica en las muestras recogidas\u201d. En la actualidad, Neoprospecta tiene a tres hospitales como clientes, dos en S\u00e3o Paulo y uno en Porto Alegre, cuyos nombres \u00e9l no puede revelar.<\/p>\n

Puede que no sea mucho, pero es algo significativo para una peque\u00f1a empresa con tan s\u00f3lo algo m\u00e1s de un a\u00f1o en funciones. La historia de Neoprospecta comenz\u00f3 en 2010, cuando Carvalho y Valter de Oliveira obtuvieron el Premio Santander de Emprendedorismo, por el modelo de negocio de la empresa. Al a\u00f1o siguiente, ganaron el Premio Iberoamericano de Innovaci\u00f3n y Emprendedorismo, organizado por la Secretar\u00eda General Iberoamericana (Segib), con sede en Madrid. Para entonces, Neoprospecta andaba despacio, porque ambos socios estaban haciendo el doctorado en la UFRGS. A finales de 2012, salieron en busca de inversores. En 2013, la empresa recibi\u00f3 un aporte de 500 mil reales de un inversor angelical y se traslad\u00f3 desde Porto Alegre al Sapiens Parque, en Florian\u00f3polis, donde atraves\u00f3 un proceso de aceleraci\u00f3n y desarrollo de su propia tecnolog\u00eda. Recientemente, Neoprospecta recibi\u00f3 una inyecci\u00f3n de recursos por 4 millones de reales del fondo Cventures Primus. \u201cEl dinero se est\u00e1 utilizando en infraestructura, en el \u00e1rea comercial, y en investigaci\u00f3n y desarrollo\u201d, relata Carvalho. \u201cAdem\u00e1s, tambi\u00e9n se emplearon esos recursos para la construcci\u00f3n de cinco laboratorios y la adquisici\u00f3n de instrumental\u201d.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"Empresa desarrolla un sistema de identificaci\u00f3n de las bacterias","protected":false},"author":20,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[192],"tags":[278,311,312],"coauthors":[112],"class_list":["post-188506","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-tecnologia-es","tag-biologia-es","tag-inmunologia","tag-innovacion"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/188506","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/20"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=188506"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/188506\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=188506"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=188506"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=188506"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=188506"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}