Cuando lleg\u00f3 a Brasil, en el mes de febrero, la nueva cepa del coronavirus que surgi\u00f3 en China se top\u00f3 con un equipo de investigadores preparados que ya ven\u00eda trabajando con el agente causante del dengue, dominaba una t\u00e9cnica de mapeo gen\u00e9tico r\u00e1pido y se aboc\u00f3, sin p\u00e9rdida de tiempo, a la secuenciaci\u00f3n de las muestras del virus extra\u00eddas de los primeros pacientes atendidos en la ciudad de S\u00e3o Paulo. Al frente de ese grupo se encuentra la m\u00e9dica Ester Sabino, una paulistana de 60 a\u00f1os, investigadora en el Instituto de Medicina Tropical de la Facultad de Medicina de la Universidad de S\u00e3o Paulo (IMT-FM-USP) y coordinadora del Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para el Descubrimiento, el Diagn\u00f3stico, la Gen\u00f3mica y la Epidemiolog\u00eda de Arbovirus (Cadde), financiado por la FAPESP y por el Medical Research Council, del Reino Unido.<\/p>\n
No es la primera vez que Sabino realiza este tipo de trabajos. Al comienzo de la d\u00e9cada de 1990, cuando se desempe\u00f1aba en el Instituto Adolfo Lutz (IAL) y en la Funda\u00e7\u00e3o Pr\u00f3-Sangue, Sabino particip\u00f3 en la secuenciaci\u00f3n de las variedades de VIH circulantes en Brasil. En a\u00f1os posteriores, la cient\u00edfica articul\u00f3 grupos de investigaci\u00f3n en transfusi\u00f3n de sangre y enfermedades tropicales para monitorear a 2 mil pacientes con enfermedad de Chagas y otros 3 mil con anemia falciforme, una afecci\u00f3n que ella estudia desde 2006.<\/p>\n
La secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica del coronavirus en tan solo dos d\u00edas les granje\u00f3 una fama repentina a los 27 cient\u00edficos que integran ese grupo, entre los cuales 17 son mujeres y 14 son becarios patrocinados por la FAPESP. Pero no por eso merm\u00f3 la preocupaci\u00f3n de Sabino por el avance de la epidemia en Brasil, tal como queda claro en la entrevista que se transcribe a continuaci\u00f3n, que ella concedi\u00f3 el d\u00eda 6 de marzo.<\/p>\n
Desde su \u00f3ptica, \u00bfqu\u00e9 suceder\u00e1 con la epidemia del nuevo coronavirus en Brasil?<\/strong> \u00bfPor qu\u00e9?<\/strong> \u00bfC\u00f3mo fue que ustedes lograron secuenciar el genoma de los dos primeros casos de coronavirus en Brasil en dos d\u00edas?<\/strong> \u201cLa mayor\u00eda de los pacientes cursan una gripe, que superan en unos d\u00edas. Debemos reservar los hospitales solamente para los casos m\u00e1s graves\u201d<\/p><\/blockquote>\n \u00bfC\u00f3mo lo consiguieron?<\/strong> \u00bfCu\u00e1l fue la participaci\u00f3n del IAL?<\/strong> \u00bfQu\u00e9 hizo usted?<\/strong> \u00bfPara qu\u00e9 podr\u00edan servir los datos de la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica del virus?<\/strong> \u00bfQu\u00e9 m\u00e1s ha hecho el Cadde?<\/strong>
\nComo la transmisi\u00f3n de este virus es muy r\u00e1pida, y es dif\u00edcil que pueda conten\u00e9rsela, ac\u00e1 ocurrir\u00e1 lo mismo que en Italia y en el Reino Unido. Resulta imposible estimar la cantidad de casos, pero a\u00fan tenemos un mes o dos antes de que la epidemia se complique. El pico sobrevendr\u00e1 entre el final de abril y el comienzo de mayo, que coincide con el apogeo de las enfermedades respiratorias en Brasil. Espero que no se junte tambi\u00e9n con un aumento en el n\u00famero de casos de dengue. Eso generar\u00eda una confusi\u00f3n total. Estamos atravesando una epidemia importante de dengue. Es dif\u00edcil definir el momento para tomar actitudes m\u00e1s dr\u00e1sticas, y es m\u00e1s complejo a\u00fan al tratarse de un virus nuevo, al cual no se lo conoce bien. Una de las grandes preocupaciones la constituyen los hospitales.<\/p>\n
\nPorque pueden ser focos de transmisi\u00f3n del virus. En Wuhan, en China, muchos pacientes infectados fueron atendidos en los hospitales y les transmitieron el virus a otras personas. Por eso es importante no acudir a un hospital sin necesidad. No hay sistema de salud en el mundo que pueda atender tanta gente al mismo tiempo. En China muchos pacientes murieron porque no hab\u00eda m\u00e9dicos o respiradores para atenderlos a todos simult\u00e1neamente. La mayor\u00eda de los pacientes sufren un estado gripal, que pasa en algunos d\u00edas. Tenemos que reservar los hospitales solo para los casos m\u00e1s graves.<\/p>\n
\nLo logramos fundamentalmente gracias a que organizamos el trabajo. La tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica r\u00e1pida est\u00e1 disponible desde la epidemia de \u00e9bola en \u00c1frica, en 2013. Aprendimos con la epidemia de zika, a partir de 2016, con la ayuda de Nick Loman, de la Universidad de Birmingham, en el Reino Unido. Como necesit\u00e1bamos muestras en buen estado del virus, Ingra Morales Claro, una alumna de doctorado que dirijo actualmente y que entonces acababa de recibirse, viaj\u00f3 a Ribeir\u00e3o Preto y tom\u00f3 100 muestras de pacientes con diagn\u00f3stico sospechoso de zika, de los cuales 16 dieron positivo. La epidemia ya estaba disip\u00e1ndose. Loman trajo los reactivos y el secuenciador port\u00e1til, denominado Minlon, para verificar si los primers<\/em> [reactivos] que \u00e9l hab\u00eda preparado podr\u00edan servir con las muestras locales. Despu\u00e9s, \u00e9l y Luiz Alc\u00e2ntara, de la Fiocruz de Bah\u00eda, junto con sus equipos de trabajo, viajaron por el nordeste del pa\u00eds para comprobar si esa t\u00e9cnica podr\u00eda utilizarse en campo. Y funcion\u00f3. No solo podemos detectar virus que ya conocemos, sino tambi\u00e9n identificar agentes desconocidos, por medio de una t\u00e9cnica denominada metagen\u00f3mica. Estamos capacitando gente en el empleo de esa t\u00e9cnica desde 2016. Morales Claro pas\u00f3 seis meses en Birmingham y dictamos varios cursos. En el caso del coronavirus, trabajamos para adaptar los primers<\/em> y reducir el costo, de 500 d\u00f3lares [2.200 reales] a 20 d\u00f3lares [89 reales].<\/p>\n
\nLo hicimos procesando varias muestras por vez. Anteriormente hac\u00edamos solo una muestra, ahora son 20 por vez. As\u00ed pudimos reducir el tiempo de cada an\u00e1lisis y podemos darle un mayor uso al flow cell<\/em>, un chip descartable. Con esta t\u00e9cnica, hacia el final de 2019 comenzamos a trabajar con el IAL en la secuenciaci\u00f3n del virus del dengue. Cuando surgi\u00f3 el coronavirus en China, Loman hizo los primers<\/em>, los envi\u00f3 a China y tambi\u00e9n nos los mand\u00f3 a nosotros. La universidad tambi\u00e9n cumple un rol en el desarrollo de tecnolog\u00eda para los organismos de la salud, que hace que las cosas funcionen, principalmente en instancias de crisis.<\/p>\n
\nEl IAL hizo todo. Nosotros solamente colaboramos y seguiremos haci\u00e9ndolo si lo necesitan. El equipo de Claudio Sacchi en el IAL fue el que secuenci\u00f3 los dos coronavirus y tambi\u00e9n lo har\u00e1 con los pr\u00f3ximos. Solamente llevamos una computadora port\u00e1til, porque en ella el programa estaba funcionando mejor. El mi\u00e9rcoles posterior al Carnaval, Sacchi recibi\u00f3 la muestra del virus del primer paciente y convoc\u00f3 a Jaqueline Goes de Jesus, quien realiza un posdoctorado en mi laboratorio, y comenzaron a trabajar. Cada secuencia en el Minlon demanda 24 horas. La primera no sali\u00f3 bien, tal vez por alg\u00fan problema en la diluci\u00f3n de los primers<\/em>, e hicieron otra. La segunda fue un \u00e9xito. El mismo d\u00eda, enviamos los datos de la secuenciaci\u00f3n a un repositorio p\u00fablico, el Gisaid [Global Initiative on Sharing All Influenza Data], siguiendo las recomendaciones de la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud de dar a conocer los resultados cient\u00edficos. Nuno Farias, de Oxford, hizo los an\u00e1lisis comparativos con otros genomas de coronavirus.<\/p>\n
\nYo me encargu\u00e9 de monitorear el trabajo. Cuando lo terminamos, en lugar de pensar en redactar un art\u00edculo cient\u00edfico de inmediato, Far\u00edas y yo elaboramos un resumen que enviamos al sitio web Virology.org. Dos d\u00edas despu\u00e9s, con el segundo virus, Sacchi y Goes de Jesus se propusieron hacerlo en 24 horas y as\u00ed lo hicieron. Eso fue el s\u00e1bado 29 de febrero y salieron de all\u00ed reci\u00e9n a las 3 de la madrugada. De mi laboratorio, quienes m\u00e1s trabajaron fueron Goes y Morales Claro, quien tambi\u00e9n est\u00e1 becada por la FAPESP. Goes utiliz\u00f3 el Minlon, que Morales hab\u00eda perfeccionado y lo emplea para hacer metagen\u00f3mica, pero todos los becarios de posdoctorado, doctorado, maestr\u00eda y capacitaci\u00f3n t\u00e9cnica est\u00e1n colaborando. Yo les repito siempre que no se circunscriban solamente a su proyecto y que aprovechen para aprender otras cosas.<\/p>\n
\nA partir de las secuencias gen\u00e9ticas pudimos determinar las similitudes entre los distintos virus identificados en cada uno de los m\u00e1s de 100 pa\u00edses en donde ya fue detectado. Esta informaci\u00f3n puede servir, en primera instancia principalmente para encauzar disposiciones sanitarias, identificando los focos a partir de los cuales ocurri\u00f3 la transmisi\u00f3n y tomando las medidas de prevenci\u00f3n, tales como el aislamiento de los sitios p\u00fablicos. Pero solo podremos hacerlo si somos capaces de detectar los casos r\u00e1pidamente.<\/p>\n
\nLos mapas de los casos de dengue en el estado de S\u00e3o Paulo, ya est\u00e1n casi listos. Estamos terminando un an\u00e1lisis de mil genomas del virus de la fiebre amarilla y capturamos mosquitos en la zona de Serra da Mantiqueira con el IAL, y en los bosques de Vale do Ribeira, con la Facultad de Salud P\u00fablica, para verificar si el virus sigue presente, tal como ocurre en la Amazonia, o si ya ha desaparecido. Tal vez a\u00fan sobreviva, si ha encontrado otro hu\u00e9sped que no muera a causa del virus.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"La cient\u00edfica que coordin\u00f3 la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica de la nueva variedad del microorganismo dice que el pico de la enfermedad en Brasil ocurrir\u00e1 entre el final de abril y el comienzo del mes de mayo","protected":false},"author":17,"featured_media":357668,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[183,1562,179],"tags":[298,306,316,329],"coauthors":[5968],"class_list":["post-355201","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-entrevista-es","category-entrevistas","category-tapa","tag-epidemiologia-es","tag-genetica-es","tag-medicina-es","tag-salud-publica","keywords-coronavirus-es","keywords-covid-19-es","keywords-covid-19-es-2"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/355201","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/17"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=355201"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/355201\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":360023,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/355201\/revisions\/360023"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/357668"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=355201"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=355201"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=355201"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=355201"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}