{"id":397562,"date":"2021-07-05T14:29:44","date_gmt":"2021-07-05T17:29:44","guid":{"rendered":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/?p=397562"},"modified":"2021-07-06T15:58:34","modified_gmt":"2021-07-06T18:58:34","slug":"el-virus-evoluciona","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/el-virus-evoluciona\/","title":{"rendered":"El virus evoluciona"},"content":{"rendered":"<p>Al cabo de un a\u00f1o de la pandemia decretada oficialmente por la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud (OMS) el 11 de marzo de 2020, la humanidad asisti\u00f3 at\u00f3nita al contagio de 122 millones de personas y a la muerte de al menos 2,7 millones, la tercera parte de estas \u00faltimas en tan solo tres pa\u00edses: Estados Unidos, Brasil y M\u00e9xico. Asimismo, pudo seguirse pr\u00e1cticamente en tiempo real y con un nivel de precisi\u00f3n tal vez nunca visto, la evoluci\u00f3n del pat\u00f3geno que puso de rodillas al sistema sanitario y afect\u00f3 profundamente a la econom\u00eda de muchas naciones. Desde su identificaci\u00f3n a finales de 2019 en la ciudad de Wuhan, en la regi\u00f3n central de China, el virus Sars-CoV-2 ha sufrido una serie de transformaciones mientras se propagaba por el planeta. A medida que infectaba progresivamente cada vez a m\u00e1s personas y se replicaba, fue acumulando peque\u00f1as modificaciones en su material gen\u00e9tico hasta que, en distintos lugares y momentos, ya era tan diferente al original que pas\u00f3 a consider\u00e1rselo una nueva variante que, al prosperar y diseminarse, empez\u00f3 a denomin\u00e1rsela como un linaje. Un linaje agrupa a ejemplares con un mismo origen y muy similares entre s\u00ed, pero que pueden tener peque\u00f1as diferencias.<\/p>\n<p>El 15 de marzo de este a\u00f1o, Nextstrain, una herramienta de visualizaci\u00f3n de genomas virales, enumer\u00f3 nada menos que 359 linajes del nuevo coronavirus catalogados desde diciembre de 2019 por el sistema de clasificaci\u00f3n Pangolin (<em>lea en la p\u00e1gina 24<\/em>). Entre tantos, tres de ellos \u2013uno que surgi\u00f3 en el Reino Unido, otro en Sud\u00e1frica y un tercero en Brasil\u2013 han generado especial preocupaci\u00f3n porque son m\u00e1s transmisibles, pueden eludir la acci\u00f3n de los anticuerpos y, en algunos casos, causan una enfermedad m\u00e1s grave que los que circulaban antes. \u201cCon las herramientas gen\u00e9ticas disponibles en la actualidad, estamos observando la evoluci\u00f3n de este pat\u00f3geno a medida que esto ocurre\u201d, dice el vir\u00f3logo Jos\u00e9 Luiz Proen\u00e7a M\u00f3dena, coordinador del Laboratorio de Estudio de Virus Emergentes de la Universidad de Campinas (Unicamp).<\/p>\n<p>La primera de estas variantes, que ya se ha convertido en un linaje y que en marzo estaba presente en 118 pa\u00edses, se detect\u00f3 el 14 de diciembre del a\u00f1o pasado en el Reino Unido. Comenz\u00f3 a circular en el mes de septiembre en el condado de Kent, en el sudeste de Inglaterra, y se propag\u00f3 r\u00e1pidamente. Inicialmente apodada como la variante Kent o brit\u00e1nica, m\u00e1s tarde se la empez\u00f3 a identificar con un fr\u00edo y sobrio conjunto de letras y n\u00fameros (B.1.1.7) definido por una nomenclatura propuesta por investigadores de Australia y del Reino Unido. Esta secuencia alfanum\u00e9rica indica que es la s\u00e9ptima variante derivada de la primera que desciende del linaje B.1, uno de los dos que surgieron originalmente en Wuhan; el otro, posiblemente m\u00e1s antiguo, es el A.1, que desapareci\u00f3 a mediados del a\u00f1o pasado. A causa de algunas alteraciones (mutaciones) que presenta en su genoma, la variante B.1.1.7 se transmite al menos dos veces m\u00e1s f\u00e1cilmente que el linaje que la origin\u00f3 y, seg\u00fan parece, tambi\u00e9n ocasiona una enfermedad m\u00e1s grave. A finales de 2020 ya hab\u00eda indicios de que podr\u00eda contribuir a un aumento de las internaciones hospitalarias en el Reino Unido, y ahora se han detectado evidencias de su asociaci\u00f3n con un mayor riesgo de muerte.<\/p>\n<\/div><div class='overflow-responsive-img' style='text-align:center'><picture data-tablet=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-0-desktop-true.png\" data-tablet_size=\"1140x512\" alt=\"\">\n    <source srcset=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-0-desktop-true.png\" media=\"(min-width: 1920px)\" \/>\n    <source srcset=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-0-desktop-true.png\" media=\"(min-width: 1140px)\" \/>\n    <img decoding=\"async\" class=\"responsive-img\" src=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-1-mobile.png\" \/>\n  <\/picture><\/div><div class=\"post-content sequence\">\n<p>En un estudio publicado el d\u00eda 15 de marzo en la revista <em>Nature<\/em>, el epidemi\u00f3logo Nicholas Davies, junto a matem\u00e1ticos y estad\u00edsticos de la Escuela de Higiene y Medicina Tropical de Londres, estimaron que una persona infectada con esta variante tiene, en promedio, un 61 % m\u00e1s de probabilidades de morir que alguien que haya contra\u00eddo cualquiera de los linajes que circulaban anteriormente. Los cient\u00edficos arribaron a esta conclusi\u00f3n tras analizar 4.945 \u00f3bitos ocurridos en un grupo de 1.146.534 brit\u00e1nicos que hab\u00edan dado positivo en el test para el nuevo coronavirus. D\u00edas antes, un grupo de investigadores dirigidos por el m\u00e9dico Robert Challen, de la Universidad de Exeter, tambi\u00e9n en el Reino Unido, presentaron un resultado similar en un art\u00edculo que sali\u00f3 publicado el 10 de marzo en la revista <em>The BMJ<\/em>. Al comparar el total de fallecidos de un grupo de 54.906 brit\u00e1nicos infectados con la variante B.1.1.7 con las muertes registradas para igual cantidad de personas que hab\u00edan sido infectadas por otro linaje del virus, comprobaron que el primer grupo se enfrentaba a un riesgo de muerte un 64 % mayor que el segundo.<\/p>\n<p>Pese a que se propaga f\u00e1cilmente entre la poblaci\u00f3n humana, en la fase inicial de la pandemia el Sars-CoV-2 parec\u00eda ser un virus relativamente manejable, que mutaba muy lentamente. En promedio, cada mes acumulaba dos mutaciones en la secuencia de casi 30 mil bases nitrogenadas, las letras qu\u00edmicas que componen su genoma, una especie de manual de instrucciones para la fabricaci\u00f3n de nuevas copias del virus. Para tener un par\u00e1metro comparativo, el influenzavirus A, causante de las pandemias de gripe, evoluciona mucho m\u00e1s r\u00e1pido: sufre una mutaci\u00f3n cada vez que se multiplica, en cuesti\u00f3n de horas, un ritmo que obliga a actualizar anualmente la composici\u00f3n de la vacuna contra la gripe.<\/p>\n<p>Hacia el final de 2020, cuando se anunciaron los resultados de la eficacia de las primeras vacunas y renac\u00eda la esperanza de que la pandemia amainara, el nuevo coronavirus volvi\u00f3 a sorprender. \u201cEmpezaron a aparecer variantes que presentaban simult\u00e1neamente a varias mutaciones y se diseminaron r\u00e1pidamente, sustituyendo a las anteriores\u201d, recuerda el vir\u00f3logo Fernando Spilki, investigador de la Universidad Feevale, en Rio Grande do Sul, y coordinador de la Red Nacional de \u00d3micas del Covid-19, la llamada Corona-\u00f3mica BR, que monitorea la circulaci\u00f3n del virus en el pa\u00eds.<\/p>\n<p>Una de estas variantes es la que origin\u00f3 el linaje B.1.1.7. La misma presenta 23 mutaciones con respecto a la B.1 de Wuhan, de las cuales 17 provocan un cambio en un amino\u00e1cido en las prote\u00ednas del virus; las otras seis son inocuas (<em>vea la infograf\u00eda debajo<\/em>). Los amino\u00e1cidos son compuestos qu\u00edmicos que, unidos en una secuencia, conforman las prote\u00ednas. En algunos casos, el reemplazo de un solo amino\u00e1cido es suficiente para alterar la estructura tridimensional de la prote\u00edna y modificar su funcionamiento.<\/p>\n<\/div><div class='overflow-responsive-img' style='text-align:center'><picture data-tablet=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-2-desktop-true.png\" data-tablet_size=\"1140x550\" alt=\"\">\n    <source srcset=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-2-desktop-true.png\" media=\"(min-width: 1920px)\" \/>\n    <source srcset=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-2-desktop-true.png\" media=\"(min-width: 1140px)\" \/>\n    <img decoding=\"async\" class=\"responsive-img\" src=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-2-mobile.png\" \/>\n  <\/picture><\/div><div class=\"post-content sequence\">\n<p>Los investigadores y los profesionales de la salud est\u00e1n preocupados porque ocho de las sustituciones de la B.1.1.7 (seis intercambios y dos eliminaciones) se producen en algunos de los 1.273 amino\u00e1cidos de la prote\u00edna denominada <em>spike<\/em> (S), precisamente la que le permite al virus adherirse a la superficie de las c\u00e9lulas humanas e invadirlas, y es el principal objetivo de los anticuerpos producidos por algunas vacunas. Hay una mutaci\u00f3n particular que llama la atenci\u00f3n: la N501Y. Esta mutaci\u00f3n conduce a la sustituci\u00f3n del amino\u00e1cido asparagina (N) por el amino\u00e1cido tirosina (Y) en la posici\u00f3n 501 de la prote\u00edna S. Este intercambio, identificado por primera vez en el linaje B.1.1.7, parece aumentar la adherencia del virus a las c\u00e9lulas y su transmisibilidad. A causa de estas caracter\u00edsticas, la agencia sanitaria Public Health England (PHE) del Reino Unido calific\u00f3 a este linaje como variante de preocupaci\u00f3n n\u00famero 1 en diciembre de 2020.<\/p>\n<p>A mediados de marzo, seg\u00fan los c\u00e1lculos de Nextstrain basados en los datos que provee el sistema Pangolin, la variante B.1.1.7 era la causante del 42 % de las nuevas infecciones por coronavirus en todo el mundo (<em>v\u00e9ase el gr\u00e1fico de la p\u00e1gina 22<\/em>). De manera independiente y casi simult\u00e1nea, la mutaci\u00f3n N501Y apareci\u00f3 tambi\u00e9n en los otros dos linajes del virus que m\u00e1s preocupan a los expertos: el B.1.351, originario de Sud\u00e1frica, y el P.1, surgido en Manaos (Brasil). Ambos se est\u00e1n expandiendo y se estima que ya causan, respectivamente, el 6 % y el 2 % de los casos de covid-19 en todo el planeta. \u201cHasta la aparici\u00f3n de la variante B.1.1.7 en el Reino Unido, cre\u00edamos que el ritmo de evoluci\u00f3n del virus era lento y que ser\u00eda posible contener el aumento de su diversidad hasta la llegada de las vacunas\u201d, comenta la m\u00e9dica Ester Sabino, de la Universidad de S\u00e3o Paulo (USP), coordinadora de uno de los equipos que identificaron la variante P.1.<\/p>\n<\/div><div class='overflow-responsive-img' style='text-align:center'><picture data-tablet=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-3-desktop-true.png\" data-tablet_size=\"1140x340\" alt=\"\">\n    <source srcset=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-3-desktop-true.png\" media=\"(min-width: 1920px)\" \/>\n    <source srcset=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-3-desktop-true.png\" media=\"(min-width: 1140px)\" \/>\n    <img decoding=\"async\" class=\"responsive-img\" src=\"\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-3-mobile.png\" \/>\n  <\/picture><\/div><div class=\"post-content sequence\">\n<p>El linaje B.1.351 se detect\u00f3 inicialmente en el \u00e1rea metropolitana de Nelson Mandela Bay, en el sur de Sud\u00e1frica, en octubre de 2020, aunque posiblemente haya surgido meses antes y fue notificado por las autoridades del pa\u00eds reci\u00e9n en diciembre. Descrito por el grupo coordinado por el vir\u00f3logo brasile\u00f1o T\u00falio de Oliveira, de la Universidad KwaZulu-Natal, en un art\u00edculo publicado en marzo de este a\u00f1o en la revista <em>Nature<\/em>, fue detectado con mayor frecuencia en individuos j\u00f3venes y sanos, y ahora ya circula localmente en Europa y en Am\u00e9rica del Norte.<\/p>\n<p>Los virus de este linaje tambi\u00e9n presentan 23 modificaciones en su genoma, ocho de ellas en el gen de la prote\u00edna S. Adem\u00e1s de la N501Y, otras dos mutaciones en la <em>spike<\/em> alertan a los expertos: la E484K, que representa el reemplazo de un glutamato (E) por una lisina (K) y que en febrero de este a\u00f1o tambi\u00e9n comenz\u00f3 a detectarse en el linaje brit\u00e1nico, y la K417N, en la que se sustituye una lisina por una asparagina (N). Estas sustituciones alteran una regi\u00f3n de la <em>spike<\/em> denominada dominio de uni\u00f3n al receptor (RBD, por sus siglas en ingl\u00e9s), que entra en contacto m\u00e1s estrechamente con el receptor ACE2 en la superficie de las c\u00e9lulas humanas y allana el camino para la entrada del virus, e impiden que ciertos anticuerpos producidos tras la aplicaci\u00f3n de algunas vacunas o por las infecciones previas con otras variantes del Sars-CoV-2 se conecten al virus y lo neutralicen. Los estudios preliminares indican que las personas infectadas con B.1.351 \u2013la segunda variante preocupante detectada en diciembre de 2020, seg\u00fan la PHE\u2013 acumulan una mayor cantidad de virus en su organismo, lo que podr\u00eda facilitar la transmisi\u00f3n, as\u00ed como beneficiarse potencialmente menos de los efectos protectores de algunas vacunas.<\/p>\n<p>Estas tres alteraciones de la <em>spike<\/em> viral tambi\u00e9n est\u00e1n presentes en el linaje P.1 originario de Brasil, que tambi\u00e9n presenta otras siete alteraciones en la misma prote\u00edna. Esta variante surgi\u00f3 a partir de la B.1.1.28, circulante en el pa\u00eds desde el comienzo de la pandemia, y fue nombrada con otra letra porque el sistema solo acepta tres conjuntos de guarismos. El linaje brasile\u00f1o posiblemente comenz\u00f3 a circular en Manaos a principios de noviembre y fue detectado al mes siguiente, en forma simult\u00e1nea, por investigadores de la USP y de la Fundaci\u00f3n Oswaldo Cruz (Fiocruz), cuando sobrevino el aumento del n\u00famero de hospitalizaciones que marc\u00f3 el inicio de la segunda ola de la pandemia en el norte del pa\u00eds, el sistema de salud en el estado de Amazonas colaps\u00f3 y hubo gente que muri\u00f3 por asfixia como consecuencia de la falta de ox\u00edgeno medicinal en los hospitales.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-4-img.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"670\" height=\"340\" class=\"aligncenter size-full wp-image-399676\" src=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-4-img.png\" alt=\"\" srcset=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-4-img.png 670w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-4-img-250x127.png 250w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/018-025_covid_variantes_302-4-img-120x61.png 120w\" sizes=\"auto, (max-width: 670px) 100vw, 670px\" \/><\/a><\/p>\n<p>Un individuo infectado por el P.1 produce, en promedio, el doble de virus que quienes se contaminaron con los linajes que circulaban previamente en Brasil, seg\u00fan pudo constatar el equipo del vir\u00f3logo Renato Santana de Aguiar, de la Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG), miembro de la red Corona-\u00f3mica BR. La presencia de una mayor cantidad de virus en el organismo aumenta de 1,4 a 2,2 veces la posibilidad de transmisi\u00f3n, seg\u00fan el c\u00e1lculo estimado por el grupo encabezado por Sabino y el biom\u00e9dico portugu\u00e9s Nuno Faria, de la Universidad de Oxford, en el Reino Unido. Otro equipo de la USP, coordinado por el bi\u00f3logo Paulo In\u00e1cio Prado, tambi\u00e9n comprob\u00f3 que el P.1 tiene una probabilidad \u2013baja, es cierto, de un 6,4 %\u2013 de volver a infectar a quienes ya se hab\u00edan contagiado con otros linajes del virus.<\/p>\n<p>Algunos expertos sostienen que, dadas estas caracter\u00edsticas del P.1, se deber\u00edan haber adoptado medidas m\u00e1s dr\u00e1sticas de salud p\u00fablica a principios de a\u00f1o para tratar de evitar la propagaci\u00f3n de este linaje, tales como un estricto control de la circulaci\u00f3n de personas y el bloqueo de los vuelos desde el estado de Amazonas a otras regiones. Sin embargo, desde el mes de diciembre, al menos 120.000 personas abandonaron Amazonas con destino a otros estados y pa\u00edses, e incluso hubo pacientes con covid-19 que fueron trasladados a otras regiones brasile\u00f1as por falta de camas.<\/p>\n<div id=\"attachment_397963\" style=\"max-width: 1150px\" class=\"wp-caption alignright\"><a href=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-2-1140.jpg\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-397963 size-full\" src=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-2-1140.jpg\" alt=\"\" width=\"1140\" height=\"814\" srcset=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-2-1140.jpg 1140w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-2-1140-250x179.jpg 250w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-2-1140-700x500.jpg 700w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-2-1140-120x86.jpg 120w\" sizes=\"auto, (max-width: 1140px) 100vw, 1140px\" \/><p class=\"wp-caption-text\"><span class=\"media-credits-inline\">Christopher Furlong\/Getty Images<\/span><\/a> Ciudadanos de Manchester, en el Reino Unido, realizan testeos en febrero de este a\u00f1o, luego del brote con el linaje B.1.1.7<span class=\"media-credits\">Christopher Furlong\/Getty Images<\/span><\/p><\/div>\n<p>Una de las consecuencias que esto gener\u00f3 es que, para mediados de marzo, el linaje P.1 ya representaba el 41 % de las infecciones provocadas por el nuevo coronavirus en Brasil (<em>v\u00e9ase el gr\u00e1fico de la p\u00e1gina 18<\/em>). Otro an\u00e1lisis que llev\u00f3 a cabo la Red Gen\u00f3mica de la Fiocruz indic\u00f3 que en menos de tres meses esta variante fue la responsable de m\u00e1s de la mitad de las infecciones en seis estados: Pernambuco (el 51 %), Rio Grande do Sul (el 63 %), R\u00edo de Janeiro (el 63 %), Santa Catarina (el 64 %), Paran\u00e1 (el 70 %) y Cear\u00e1 (el 71 %). \u201cTodo el pa\u00eds est\u00e1 viviendo ahora una situaci\u00f3n similar a la que atraves\u00f3 Manaos en el mes de diciembre, con el P.1 en plena propagaci\u00f3n\u201d, dice Sabino, quien coordina a nivel local el Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para la Detecci\u00f3n, el Diagn\u00f3stico, la Gen\u00f3mica y la Epidemiolog\u00eda de los Arbovirus (Cadde), financiado por la agencia brit\u00e1nica Medical Research Council y la FAPESP.<\/p>\n<p>\u201cBrasil se ha transformado en un terreno f\u00e9rtil para la aparici\u00f3n de variantes y linajes m\u00e1s contagiosos\u201d, dice el vir\u00f3logo Eurico Arruda, de la USP de Ribeir\u00e3o Preto, quien lleva casi tres d\u00e9cadas estudiando los coronavirus (<a href=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/eurico-arruda-un-admirador-de-los-virus\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><em>lea en <\/em>Pesquisa FAPESP<em>, edici\u00f3n n\u00ba 301<\/em><\/a>). La poblaci\u00f3n susceptible de contraer el virus es numerosa, la vacunaci\u00f3n en el pa\u00eds es muy lenta y las medidas de prevenci\u00f3n, como el distanciamiento social y el uso de mascarillas, no se han adoptado con eficacia en todas las regiones. \u201cCuanta m\u00e1s gente infecte el virus, m\u00e1s se multiplicar\u00e1 y m\u00e1s sufrir\u00e1 alteraciones\u201d, explica.<\/p>\n<p>Los virus son microorganismos naturalmente propensos a acumular mutaciones en su genoma, pues, a diferencia de los seres vivos formados por c\u00e9lulas, no disponen de mecanismos eficaces para corregir los errores. A medida que el material gen\u00e9tico viral se replica para generar nuevas copias del virus, se producen alteraciones aleatorias, de una manera similar a las que ocurren cuando alguien copia a mano un texto muy extenso (aunque lo ejecute con suma atenci\u00f3n). Sin prote\u00ednas que detecten eficazmente las imprecisiones y las desbaraten, las mutaciones acaban incorpor\u00e1ndose al material gen\u00e9tico de los nuevos virus que, en el caso del Sars-CoV-2, es una mol\u00e9cula de ARN de cadena simple.<\/p>\n<div id=\"attachment_397959\" style=\"max-width: 1150px\" class=\"wp-caption alignright\"><a href=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-1-1140.jpg\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-397959 size-full\" src=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-1-1140.jpg\" alt=\"\" width=\"1140\" height=\"760\" srcset=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-1-1140.jpg 1140w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-1-1140-250x167.jpg 250w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-1-1140-700x467.jpg 700w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-1-1140-120x80.jpg 120w\" sizes=\"auto, (max-width: 1140px) 100vw, 1140px\" \/><p class=\"wp-caption-text\"><span class=\"media-credits-inline\">Rodger Bosch\/AFP v\u00eda Getty Images<\/span><\/a> Profesional de la salud efect\u00faa controles a un paciente con covid-19 en Sud\u00e1frica, tras la aparici\u00f3n de una nueva variante<span class=\"media-credits\">Rodger Bosch\/AFP v\u00eda Getty Images<\/span><\/p><\/div>\n<p>\u201cLas mutaciones constituyen algo habitual, pero no todas son importantes para incrementar la transmisibilidad o la patogenicidad del virus\u201d, explica la bioqu\u00edmica Marilda Siqueira, del Laboratorio de Virus Respiratorios y Sarampi\u00f3n, de la Fiocruz, un instituto referente en vigilancia gen\u00f3mica del coronavirus para el Ministerio de Salud y la OMS. Otras, sin embargo, pueden conferirle al virus una ventaja adaptativa y le permiten, por ejemplo, penetrar con mayor facilidad en las c\u00e9lulas, multiplicarse m\u00e1s o eludir la acci\u00f3n de los anticuerpos. En estos casos, quedan incorporadas en el genoma del virus y se transmiten a las generaciones futuras.<\/p>\n<p>\u201cSospechamos que este es el caso de las mutaciones N501Y, E484K y K417N, que aparecieron de manera independiente en las variantes que surgieron en diferentes lugares del mundo y parecen acrecentar la aptitud viral\u201d, dice Aguiar, de la UFMG. Adem\u00e1s de estar presentes en el linaje P.1, en el B.1.351 de origen sudafricano y desde principios de a\u00f1o tambi\u00e9n en el B.1.1.7 brit\u00e1nico, aparece igualmente en el material gen\u00e9tico de otras dos variantes brasile\u00f1as, identificadas con la ayuda del grupo de Siqueira: la P.2, que ya se disemin\u00f3 por todo el pa\u00eds, y la N.9, detectada a principios de marzo. Todav\u00eda se las est\u00e1 investigando y, por ahora, no son tan preocupantes como el linaje P.1.<\/p>\n<p>\u201cPienso que, con el tiempo, surgir\u00e1n variantes m\u00e1s transmisibles, pero que causen una enfermedad m\u00e1s leve, como ocurri\u00f3 con el virus de la gripe A, que caus\u00f3 la pandemia de gripe espa\u00f1ola en 1918\u201d, dice Arruda. Un an\u00e1lisis de la diversidad gen\u00e9tica del Sars-CoV-2 en 1.313 personas, publicado el 9 de marzo en la revista <em>Science<\/em>, elaborado por la epidemi\u00f3loga Katrina Lythgoe y colaboradores, de la Universidad de Oxford, sugiere que el desarrollo de variantes m\u00e1s transmisibles que escapan a la acci\u00f3n del sistema de defensa es inusual. Sin embargo, una vez que emergen, pueden propagarse r\u00e1pidamente.<\/p>\n<p>Adem\u00e1s de permitirle al virus propagarse con mayor facilidad, las mutaciones detectadas en los nuevos linajes han generado preocupaci\u00f3n en muchos expertos por la amenaza que pueden suponer para la eficacia de las vacunas. Los inmunizantes desarrollados por las empresas farmac\u00e9uticas estadounidenses Janssen y Novavax, por ejemplo, ya han mostrado una menor eficacia contra la variante sudafricana B.1.351. Al igual que Novavax, la vacuna desarrollada en conjunto por la Universidad de Oxford y la empresa farmac\u00e9utica anglosueca AstraZeneca, que tambi\u00e9n pierde parte de su efecto contra el linaje B.1.1.7, procedente del Reino Unido. No obstante, su rendimiento es mucho peor contra el linaje sudafricano. Se observ\u00f3 una importante reducci\u00f3n en su capacidad de prevenir los casos leves y moderados de la enfermedad causada por el B.1.351 (no hubo casos graves en el grupo vacunado ni en el que recibi\u00f3 placebo), seg\u00fan muestran los resultados de un ensayo cl\u00ednico con alrededor de 2.000 participantes que sali\u00f3 publicado el 16 de marzo en la revista <em>New England Journal of Medicine<\/em>.<\/p>\n<div id=\"attachment_397967\" style=\"max-width: 1150px\" class=\"wp-caption alignright\"><a href=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-3-1140.jpg\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-397967 size-full\" src=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-3-1140.jpg\" alt=\"\" width=\"1140\" height=\"814\" srcset=\"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-3-1140.jpg 1140w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-3-1140-250x179.jpg 250w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-3-1140-700x500.jpg 700w, https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/018-025_covid_variantes_302-3-1140-120x86.jpg 120w\" sizes=\"auto, (max-width: 1140px) 100vw, 1140px\" \/><p class=\"wp-caption-text\"><span class=\"media-credits-inline\">Michael Dantas\/AFP v\u00eda Getty Images<\/span><\/a> Un paciente derivado para su hospitalizaci\u00f3n en Manaos, en Brasil, durante el mes de enero, en medio de una nueva ola de contagios<span class=\"media-credits\">Michael Dantas\/AFP v\u00eda Getty Images<\/span><\/p><\/div>\n<p>Los estudios realizados por el grupo de M\u00f3dena en la Unicamp, y por el equipo del inmun\u00f3logo Michael Diamond, de la Universidad de Washington en Saint Louis, Estados Unidos, identificaron, respectivamente, cierto nivel de p\u00e9rdida de efecto de los anticuerpos producidos por la CoronaVac y por la vacuna de Pfizer contra la variante P.1 en pruebas <em>in vitro<\/em>. Empero, a\u00fan no puede afirmarse que estas variantes esquiven el efecto de las vacunas en las personas. La literatura cient\u00edfica sobre el tema a\u00fan muestra contradicciones y otros estudios han llegado a conclusiones distintas. De todas maneras, a finales del mes de febrero algunos fabricantes de vacunas anunciaron que est\u00e1n trabajando en dosis de refuerzo y en otras f\u00f3rmulas que contemplan las mutaciones de las nuevas variantes.<\/p>\n<p>Asimismo, los anticuerpos no solamente funcionan acopl\u00e1ndose al virus y bloqueando su entrada en las c\u00e9lulas. Tambi\u00e9n pueden desencadenar reacciones qu\u00edmicas perjudiciales para las part\u00edculas virales o actuar como marcadores, permitiendo su reconocimiento por las c\u00e9lulas de defensa que los fagocitan y los digieren. \u201cLa evaluaci\u00f3n de otras estrategias del sistema inmunitario, tal como es el caso de la actividad de las c\u00e9lulas de defensa, es m\u00e1s laboriosa, pero es esencial para arribar a conclusiones m\u00e1s s\u00f3lidas\u201d, comenta el biom\u00e9dico William Souza, quien realiza una pasant\u00eda posdoctoral en la Universidad de Oxford y colabor\u00f3 en los experimentos de M\u00f3dena y Sabino. \u201cLas vacunas siguen evitando que la gente enferme y muera\u201d.<\/p>\n<p>Para M\u00f3dena, los resultados obtenidos hasta ahora contra los nuevos linajes del virus refuerzan la idea de que incluso aquellos que ya han padecido la enfermedad o han sido vacunados deben mantener los cuidados, seguir utilizando mascarillas y adoptando medidas de higiene y distanciamiento social. \u201cDe momento, lo que se sabe es que quienes ya han tenido covid-19 o incluso los que han recibido algunas de las vacunas pueden reinfectarse con el virus de uno de los linajes preocupantes\u201d, dice. En una encuesta realizada en enero por la revista <em>Nature<\/em> a la que respondieron cien vir\u00f3logos, inmun\u00f3logos y expertos en enfermedades infecciosas de diferentes pa\u00edses, el 90 % dijo que supon\u00edan que el virus podr\u00eda tornarse end\u00e9mico y seguir circulando en peque\u00f1os nichos durante los pr\u00f3ximos a\u00f1os, ya sea porque escapa a la acci\u00f3n de los anticuerpos, porque no habr\u00e1 vacunas suficientes para todos, porque algunos se niegan a vacunarse o porque siguieron infectando a animales en la naturaleza.<\/p>\n<div class=\"box\"><strong>El surgimiento de los linajes<\/strong><br \/>\n<em>La secuenciaci\u00f3n del genoma permite realizar un seguimiento de las transformaciones del virus<\/em><\/p>\n<p>Para monitorear el surgimiento de variantes y linajes, los expertos secuencian el material gen\u00e9tico de los virus circulantes en cierto momento y en una regi\u00f3n determinada y lo comparan con el que exist\u00eda anteriormente. Hasta comienzos de marzo, se hab\u00edan secuenciado en todo el mundo casi 670 mil genomas del Sars-CoV-2; y unas 4.000 de esas secuenciaciones se hicieron en Brasil. En la actualidad, el pa\u00eds cuenta con al menos tres redes de laboratorios que realizan monitoreo gen\u00f3mico en forma sistem\u00e1tica: la Red Gen\u00f3mica de la Fiocruz, financiada por el Ministerio de Salud nacional, la Red Nacional de \u00d3micas de Covid-19 (Corona-\u00f3mica BR), con el respaldo del Ministerio de Ciencia, Tecnolog\u00eda e Innovaci\u00f3n, y el Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para la Detecci\u00f3n, el Diagn\u00f3stico, la Gen\u00f3mica y la Epidemiolog\u00eda de los Arbovirus (Cadde), que se mantiene con fondos aportados por la agencia brit\u00e1nica Medical Research Council y por la FAPESP. \u201cNecesitamos ampliar nuestra capacidad de secuenciaci\u00f3n y estamos encarando ese proyecto\u201d, comenta la bioqu\u00edmica Marilda Siqueira, investigadora de la Red Gen\u00f3mica de la Fiocruz. \u201cAs\u00ed y todo, hemos sido capaces de detectar la irrupci\u00f3n del linaje brit\u00e1nico en varios estados y registramos el inicio de la circulaci\u00f3n del P.1, el P.2 y el N.9\u201d. La secuenciaci\u00f3n del genoma demanda el uso de reactivos importados, demora d\u00edas de trabajo y cuesta alrededor de 600 reales. Para mejorar la vigilancia, algunos laboratorios brasile\u00f1os han dise\u00f1ado test moleculares (PCR) que permiten detectar los nuevos linajes del virus. Uno de ellos es el de la Fiocruz en el estado de Amazonas. Otro es el del vir\u00f3logo Renato Santana Aguiar, de la UFMG, que identifica las variantes P.1, P.2, B.1.1.7 y B.1.351. \u201cEl test tiene un costo de 60 reales y est\u00e1 listo en algunas horas\u201d, relata Santana Aguiar. \u201cNos permitir\u00e1 conocer con mayor precisi\u00f3n la circulaci\u00f3n de esos linajes\u201d. Sin embargo, la determinaci\u00f3n del genotipo mediante el PCR no reemplaza a la secuenciaci\u00f3n, que es la \u00fanica forma de identificar el surgimiento de nuevas variantes y linajes.<\/div>\n<div class=\"box\"><strong>D\u00e1ndole un nombre al virus<\/strong><br \/>\n<em>Los sistemas adoptan distintas estrategias para denominar a los linajes<\/em><\/p>\n<p>Quienes hayan le\u00eddo algo sobre los nuevos linajes y variantes del nuevo coronavirus se habr\u00e1n topado con secuencias de letras y n\u00fameros que parecen no tener sentido. Son intentos de organizar el conocimiento disponible sobre el virus y seguir de cerca su difusi\u00f3n y su evoluci\u00f3n. En los \u00faltimos meses se conocieron al menos tres estrategias para nombrarlos. Una de ellas es un sistema propuesto por el bi\u00f3logo Andrew Rambaut, de la Universidad de Edimburgo, en Escocia, al cual se lo conoce por la sigla Pangolin, acr\u00f3nimo de Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages. Este sistema provee informaci\u00f3n detallada sobre la circulaci\u00f3n del virus en un momento determinado. En el mismo, las variantes o linajes se clasifican seg\u00fan el grado de parentesco evolutivo, atribuy\u00e9ndoles una letra seguida por hasta tres n\u00fameros: por ejemplo, el linaje que se origin\u00f3 en el Reino Unido es el B.1.1.7, la s\u00e9ptima variante derivada de la primera que deriva del linaje B.1, uno de los dos que surgieron originalmente en Wuhan. El linaje sudafricano es el B.1.351 (el 351\u00ba descendiente del B.1). En tanto, el brasile\u00f1o, por ser descendiente del linaje B.1.1.28, que ya ten\u00eda tres n\u00fameros, recibi\u00f3 una nueva letra y se convirti\u00f3 en el P.1. Un segundo sistema de clasificaci\u00f3n es el Nextstrain, propuesto por el grupo de Trevor Bedford y sus colaboradores, del Centro de Investigaci\u00f3n del C\u00e1ncer Fred Hutchinson, de Estados Unidos. Este sistema agrupa a los virus en conjuntos m\u00e1s grandes (clados), que son descritos por el a\u00f1o de identificaci\u00f3n del clado, seguido de una letra y el nombre de una mutaci\u00f3n que define al grupo. As\u00ed, el linaje del Reino Unido forma parte del clado 20I\/501Y.V1, el de Sud\u00e1frica es 20H\/501.V2 y el de Brasil, 20J\/501.V3. El tercer sistema de clasificaci\u00f3n proviene de un consorcio internacional creado en 2008 cuyo nombre es Gisaid. Este ha sido el que ha adoptado la OMS, y tambi\u00e9n agrupa a los virus por clados, definidos por una o m\u00e1s letras que integran las mutaciones principales del grupo. All\u00ed el linaje del Reino Unido se incluye en el clado GRY, el de Sud\u00e1frica en el GH y el de Brasil, en el GR.<\/div>\n<p class=\"bibliografia separador-bibliografia\"><strong>Proyectos<\/strong><br \/>\n<strong>1<\/strong>. Centro conjunto Brasil-Reino Unido para el descubrimiento, el diagn\u00f3stico, la gen\u00f3mica y la epidemiolog\u00eda de arbovirus (Cadde) (<a href=\"https:\/\/bv.fapesp.br\/pt\/auxilios\/103130\/centro-conjunto-brasil-reino-unido-para-descoberta-diagnostico-genomica-e-epidemiologia-de-arbovirus\/?q=18\/14389-0\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">n\u00ba 18\/14389-0<\/a>); <strong>Modalidad<\/strong> Proyecto Tem\u00e1tico; <strong>Investigadora responsable<\/strong> Ester Cerdeira Sabino (USP); <strong>Inversi\u00f3n<\/strong> R$ 5.331.725,16.<br \/>\n<strong>2.<\/strong> ICTP \u2013 Instituto sudamericano de f\u00edsica fundamental. Un centro regional de f\u00edsica te\u00f3rica (<a href=\"https:\/\/bv.fapesp.br\/pt\/auxilios\/94799\/ictp-instituto-sul-americano-para-fisica-fundamental-um-centro-regional-para-fisica-teorica\/?q=16\/01343-7\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">n\u00ba 16\/01343-7<\/a>); <strong>Modalidad<\/strong> Proyecto Tem\u00e1tico; <strong>Investigador responsable<\/strong> Nathan Jacob Berkovits (Unesp); <strong>Inversi\u00f3n<\/strong> R$ 15.421.379,38.<br \/>\n<strong>3.<\/strong> Patog\u00e9nesis y neurovirulencia de virus emergentes en Brasil (<a href=\"https:\/\/bv.fapesp.br\/pt\/auxilios\/95761\/patogenese-e-neurovirulencia-de-virus-emergentes-no-brasil\/?q=16\/00194-8\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">n\u00ba 16\/00194-8<\/a>); <strong>Modalidad<\/strong> Joven Investigador; <strong>Investigador responsable<\/strong> Jos\u00e9 Luiz Proen\u00e7a M\u00f3dena (Unicamp); <strong>Inversi\u00f3n<\/strong> R$ 2.509.395,80.<br \/>\n<strong>4.<\/strong> Caracterizaci\u00f3n de factores de riesgo intr\u00ednsecos y desarrollo de nuevas alternativas de diagn\u00f3stico y tratamiento del covid-19 (<a href=\"https:\/\/bv.fapesp.br\/pt\/auxilios\/106222\/caracterizacao-de-fatores-de-risco-intrinsecos-e-o-desenvolvimento-de-novas-alternativas-de-diagnost\/?q=20\/04558-0\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">n\u00ba 20\/04558-0<\/a>); <strong>Modalidad<\/strong> Ayuda de Investigaci\u00f3n &#8211; Regular; <strong>Investigador responsable<\/strong> Jos\u00e9 Luiz Proen\u00e7a M\u00f3dena (Unicamp); <strong>Inversi\u00f3n<\/strong> R$ 184.077,00.<br \/>\n<strong>5.<\/strong> Replicaci\u00f3n y efectos celulares de rinovirus en tejidos linfoides (<a href=\"https:\/\/bv.fapesp.br\/pt\/auxilios\/103494\/replicacao-e-efeitos-celulares-de-rinovirus-em-tecidos-linfoides\/?q=18\/25605-6\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">n\u00ba 18\/25605-6<\/a>); <strong>Modalidad<\/strong> Ayuda de Investigaci\u00f3n \u2013 Regular; <strong>Investigador responsable<\/strong> Eurico de Arruda Neto (FMRP-USP); <strong>Inversi\u00f3n<\/strong> R$ 236.000,00.<\/p>\n<p class=\"bibliografia\"><strong>Art\u00edculos cient\u00edficos<\/strong><br \/>\nDAVIES, M. G. <em>et al<\/em>. <a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41586-021-03426-1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Increased mortality in community-tested cases of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7<\/a>. <strong>Nature<\/strong>. 15 mar. 2021.<br \/>\nCHALLEN, R. <em>et al.<\/em> <a href=\"https:\/\/www.bmj.com\/content\/372\/bmj.n579\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012\/1: matched cohort study<\/a>. <strong>The BMJ<\/strong>. 10 mar. 2021.<br \/>\nTEGALLY, H. <em>et al.<\/em> <a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41586-021-03402-9\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Emergence of a SARS-CoV-2 variant of concern with mutations in spike glycoprotein<\/a>. <strong>Nature<\/strong>. 9 mar. 2021.<br \/>\nNAVECA, F. <em>et al.<\/em> <a href=\"https:\/\/virological.org\/t\/phylogenetic-relationship-of-sars-cov-2-sequences-from-amazonas-with-emerging-brazilian-variants-harboring-mutations-e484k-and-n501y-in-the-spike-protein\/585\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Phylogenetic relationship of SARS-CoV-2 sequences from Amazonas with emerging Brazilian variants harboring mutations E484K and N501Y in the Spike protein<\/a>. <strong>Virological.org<\/strong>. 11 ene. 2021.<br \/>\nFARIA, N. R.<em> et al.<\/em> <a href=\"https:\/\/virological.org\/t\/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings\/586\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings<\/a>. <strong>Virological.org<\/strong>. 12 ene. 2021<br \/>\nFUJINO, T.<em> et al.<\/em> <a href=\"https:\/\/pubmed.ncbi.nlm.nih.gov\/33567247\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Novel SARS-CoV-2 Variant in Travelers from Brazil to Japan<\/a>. <strong>Emerging Infectious Diseases.<\/strong> 10 feb. 2021.<br \/>\nNAVECA, F. <em>et al.<\/em> <a href=\"https:\/\/assets.researchsquare.com\/files\/rs-275494\/v1\/e3506c53-2490-428b-b65d-2a6e1c3d12fd.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">COVID-19 epidemic in the Brazilian state of Amazonas was driven by long-term persistence of endemic SARS-CoV-2 lineages and the recent emergence of the new Variant of Concern P.1.<\/a> <strong>Research Square<\/strong>. 25 feb. 2021.<br \/>\nRESENDE, P. 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