{"id":514341,"date":"2024-06-11T14:01:46","date_gmt":"2024-06-11T17:01:46","guid":{"rendered":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/?p=514341"},"modified":"2024-06-11T14:01:46","modified_gmt":"2024-06-11T17:01:46","slug":"los-ingredientes-para-que-la-receta-funcione","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/los-ingredientes-para-que-la-receta-funcione\/","title":{"rendered":"Los ingredientes para que la receta funcione"},"content":{"rendered":"<p>Una red compuesta por 554 investigadores de 39 pa\u00edses propuso un conjunto de directrices para la publicaci\u00f3n de las im\u00e1genes obtenidas por microscop\u00eda \u00f3ptica en los art\u00edculos cient\u00edficos del campo de las ciencias biol\u00f3gicas y biom\u00e9dicas. La iniciativa apunta a permitir la correcta interpretaci\u00f3n de las figuras y, principalmente, facilitar la reproducci\u00f3n de sus resultados por otros grupos de investigaci\u00f3n. En un art\u00edculo publicado en septiembre en la revista <em>Nature Methods<\/em>, un grupo de representantes de este consorcio recomend\u00f3 el uso, tanto para los autores de los <em>papers<\/em> como para los revisores y editores de revistas cient\u00edficas, de listas de verificaci\u00f3n capaces de constatar si una imagen fue procesada en forma apropiada y si contiene informaci\u00f3n suficiente como para que pueda entenderse y replicarse. El objetivo es detectar y corregir los problemas que pudieran presentar las figuras antes de su publicaci\u00f3n. \u201cLas <em>checklists<\/em> proporcionan instrucciones claras y sencillas sobre c\u00f3mo publicar y analizar im\u00e1genes, lo que representa un gran avance para hacerlas reproducibles, comprensibles y accesibles\u201d, se\u00f1ala el autor principal del art\u00edculo, el cient\u00edfico de datos Christopher Schmied, del Instituto Leibniz de Investigaciones en Farmacolog\u00eda Molecular, en Berl\u00edn (Alemania), en su perfil en la red profesional LinkedIn.<\/p>\n<p>Las listas de comprobaci\u00f3n propuestas abarcan diversos par\u00e1metros de las im\u00e1genes, entre ellos formatos est\u00e1ndar, tratamiento del color e inscripciones o etiquetas a\u00f1adidas por el autor, y se dividen en tres niveles de exigencia: m\u00ednimo, recomendado e ideal. El nivel m\u00ednimo contempla los requisitos indispensables para que las conclusiones cient\u00edficas representadas por una imagen puedan ser confirmadas por otros grupos, como los datos que se refieren al origen de la figura y los m\u00e9todos de procesamiento empleados. El cumplimiento de estos requisitos \u2012que abarcan, por ejemplo, una explicaci\u00f3n de las maniobras realizadas para ampliar los detalles de una imagen, informar el grado de ajuste del brillo y contraste o compartir los datos originales en repositorios\u2012 puede ayudar a detectar faltantes claves antes de la publicaci\u00f3n de un trabajo, evitando dudas y cuestionamientos.<\/p>\n<p>El nivel recomendado, en tanto, es m\u00e1s exigente y procura garantizar que el hallazgo contenido en la imagen se comprenda f\u00e1cilmente. Un ejemplo es la sugerencia de incluir una escala de intensidad crom\u00e1tica que ayude a explicar el sentido de los colores exhibidos. El tercer nivel, calificado como ideal, establece pr\u00e1cticas complementarias, como poner a disposici\u00f3n copias de las figuras originales en bancos de datos especializados en ese tipo de documentos u ofrecer versiones de las im\u00e1genes en gama de grises para permitir su comparaci\u00f3n con las originales en colores.<\/p>\n<p>Su publicaci\u00f3n en blanco y negro ya ser\u00eda suficiente, seg\u00fan las directrices. \u201cRecomendamos a todos que publiquen sus im\u00e1genes en blanco y negro en lugar de la versi\u00f3n en color, porque la vista humana es muy sensible a los detalles en las figuras monocrom\u00e1ticas\u201d, explica una de las integrantes de la iniciativa, la bi\u00f3loga inglesa Alison North, directora del Centro de Recursos de Bioim\u00e1genes (Birc) de la Universidad Rockefeller (EE. UU.), en el sitio web <em>ScienceDaily<\/em>. \u201cMuchos investigadores son adeptos a las im\u00e1genes en colores porque son hermosas e impresionantes. No advierten que, en realidad, est\u00e1n desperdiciando gran cantidad de informaci\u00f3n\u201d. Adem\u00e1s de apuntar estrategias para la obtenci\u00f3n de im\u00e1genes fiables, el grupo tambi\u00e9n enumer\u00f3 m\u00e9todos que deben evitarse en determinadas situaciones. Un ejemplo es la interpolaci\u00f3n, que consiste en la creaci\u00f3n de nuevos p\u00edxeles en una imagen, a partir de los existentes, para realzar su nitidez: no debe aplic\u00e1rsela en im\u00e1genes ampliadas cuya resoluci\u00f3n sea baja, porque el riesgo de generar distorsiones es alto.<\/p>\n<p>Las directrices consolidan un esfuerzo de cooperaci\u00f3n que comenz\u00f3 en 2020 con la constituci\u00f3n de la iniciativa bautizada Evaluaci\u00f3n de la Calidad y Reproducibilidad de Instrumental e Im\u00e1genes en la Microscop\u00eda \u00d3ptica (Quarep-LiMi), integrada por investigadores de universidades y empresas de diversos pa\u00edses interesados en establecer est\u00e1ndares y protocolos para el uso de im\u00e1genes en la microscop\u00eda. Una de las preocupaciones principales de la red era tratar de disminuir la cantidad de confusiones y manipulaciones indebidas en las im\u00e1genes, que a menudo suelen ser causal de retractaci\u00f3n de art\u00edculos. El objetivo es combatir lo que se ha acordado llamar como crisis de reproducibilidad, esto es, la repetici\u00f3n de casos de art\u00edculos cient\u00edficos, sobre todo en \u00e1reas tales como la medicina, ciencias de la vida y psicolog\u00eda, que han ca\u00eddo en descr\u00e9dito porque sus resultados no han podido confirmarse en experimentos ulteriores.<\/p>\n<p>\u201cSi los cient\u00edficos se avienen a adoptar un est\u00e1ndar m\u00ednimo para la publicaci\u00f3n de im\u00e1genes, reproducir los resultados ser\u00e1 mucho m\u00e1s f\u00e1cil para todos\u201d, explica el analista de im\u00e1genes Ved Sharma, investigador del Birc, tambi\u00e9n a <em>ScienceDaily<\/em>. \u201cHay mucha informaci\u00f3n que podr\u00eda incluirse en una imagen, pero en la mayor\u00eda de las ocasiones no est\u00e1 disponible o el lector debe profundizar en la lectura del art\u00edculo para entender el sentido de la figura\u201d.<\/p>\n<p>Las listas de comprobaci\u00f3n de Quarep-LiMi tambi\u00e9n incluyen el detalle de las fases y protocolos para la obtenci\u00f3n y procesamiento de las im\u00e1genes, los llamados flujos de trabajo, que pueden comprender etapas tales como la reconstrucci\u00f3n, segmentaci\u00f3n, etiquetado y an\u00e1lisis estad\u00edstico. Los flujos de trabajo pueden agruparse en tres categor\u00edas: los ya establecidos, los nuevos y los que se basan en el aprendizaje autom\u00e1tico. Para un flujo preestablecido, el requisito de nivel m\u00ednimo es informar cada etapa, mientras que una caracter\u00edstica del <em>checklist <\/em>en el nivel ideal contempla la facilitaci\u00f3n de un tutorial sobre c\u00f3mo se ha trabajado con la imagen. En cambio, para los flujos de trabajo creados recientemente, las exigencias son m\u00e1s amplias: es esencial describir cada una de los pasos y componentes para que otros investigadores puedan generar las mismas condiciones y verificar los resultados. Para los flujos que utilizan aprendizaje autom\u00e1tico, se recomienda como medida adicional, informar qu\u00e9 datos se utilizaron para entrenar a los modelos de inteligencia artificial y poner sus c\u00f3digos a disposici\u00f3n de los interesados.<\/p>\n<p>Seg\u00fan el estudio publicado en <em>Nature Methods<\/em>, las directrices tambi\u00e9n pueden ser \u00fatiles para promover la confiabilidad de otros tipos de im\u00e1genes cient\u00edficas, tales como las fotograf\u00edas, im\u00e1genes de pruebas de diagn\u00f3stico o las obtenidas por microscop\u00eda electr\u00f3nica de barrido, aunque no se las haya creado con ese prop\u00f3sito. Un obst\u00e1culo para la implementaci\u00f3n de directrices de este tipo son los costos adicionales que suelen implicar para los investigadores, que pueden llegar a ser prohibitivos para los cient\u00edficos de los pa\u00edses de ingresos medianos y bajos. Para resolver este problema, los art\u00edfices de Quarep-LiMi han aceptado flexibilizar algunos requisitos, principalmente los que se encuadran en el nivel ideal. El almacenamiento de datos en repositorios especializados en im\u00e1genes, un requerimiento costoso, se considera negociable. \u201cPara ser inclusivos, no podremos imponer la utilizaci\u00f3n de repositorios en l\u00ednea, pero como medida m\u00ednima, les exigimos a los cient\u00edficos que est\u00e9n dispuestos a compartir sus datos\u201d, escribieron en el art\u00edculo.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"Un consorcio propone listas de comprobaci\u00f3n para asegurarse de que las im\u00e1genes de microscop\u00eda en los art\u00edculos cient\u00edficos puedan entenderse y confirmarse","protected":false},"author":11,"featured_media":514342,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[178],"tags":[299],"coauthors":[98],"class_list":["post-514341","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-buenas-practicas","tag-etica-es"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/514341","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/11"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=514341"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/514341\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":514346,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/514341\/revisions\/514346"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/514342"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=514341"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=514341"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=514341"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=514341"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}