{"id":73270,"date":"2000-12-01T00:00:00","date_gmt":"2000-12-01T00:00:00","guid":{"rendered":"http:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/2000\/12\/01\/una-nueva-red-para-los-virus\/"},"modified":"2015-02-20T17:06:46","modified_gmt":"2015-02-20T19:06:46","slug":"una-nueva-red-para-los-virus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/una-nueva-red-para-los-virus\/","title":{"rendered":"Una nueva red para los virus"},"content":{"rendered":"

La FAPESP acaba de crear la Red de Diversidad Gen\u00e9tica de Virus (VGDN, sigla en ingl\u00e9s de\u00a0Viral Genetic Diversity Network<\/em>), una ramificaci\u00f3n del Programa Genoma FAPESP. La VGDN va a estudiar ese tipo de microorganismos que alberga a los menores agentes causantes de procesos infecciosos de los cuales de tenga noticia. Y pese a que tienen un genoma peque\u00f1o, estudiarlos es fundamental para entender la diversidad entre las cepas y sus mutaciones. La red tiene por objeto conocer, en los pr\u00f3ximos cuatro a\u00f1os, las variedades gen\u00e9ticas de cuatro virus: el VIH-1, tipo de virus del SIDA m\u00e1s com\u00fan en Brasil; el HCV, agente causante de la hepatitis C; el Hantavirus, que provoca un todav\u00eda misterioso s\u00edndrome pulmonar; y el VRS (virus respiratorio sincicial), responsable de infecciones del tracto respiratorio, en especial en ni\u00f1os.<\/p>\n

El programa, presupuestado en 8 millones de d\u00f3lares, va a crear una red estadual de 17 laboratorios con la intenci\u00f3n radiografiar las mutaciones y variedades gen\u00e9ticas de los virus a partir de muestras de dichos agentes patol\u00f3gicos recogidas en las principales regiones del estado de S\u00e3o Paulo. “Con la VGDN estaremos en condiciones de realizar una serie de trabajos tales como identificar los tipos dominantes de virus en el Estado, hacer estudios sobre la genealog\u00eda de dichos organismos, establecer cadenas de transmisi\u00f3n e, incluso, saber qui\u00e9n pas\u00f3 el virus a qui\u00e9n y qui\u00e9n se contagi\u00f3 de qui\u00e9n”, dice Jos\u00e9 C\u00e1ssio de Moraes, director del Centro de Vigilancia Epidemiol\u00f3gica (CVE), de la Secretar\u00eda de Estado de Salud, encargado de coordinar la parte de epidemiolog\u00eda del proyecto.<\/p>\n

M\u00e1s all\u00e1 de que son organismos con estructuras gen\u00e9ticas inestables, los cuatro virus del nuevo proyecto tienen caracter\u00edsticas comunes, factor que pes\u00f3 en su elecci\u00f3n como objeto de estudio de la VGDN. Todos causan enfermedades con alto grado de letalidad, para las cuales a\u00fan no existen vacunas. Con excepci\u00f3n del s\u00edndrome causado por el Hantavirus, una dolencia a\u00fan considerada rara, las dem\u00e1s patolog\u00edas presentan altos \u00edndices de incidencia en el estado de S\u00e3o Paulo. Una vez terminado el trabajo de mapeo de esos cuatro virus, la VGDN se transformar\u00e1 en una red permanente y probablemente ser\u00e1 incorporada a la Secretar\u00eda de Estado de Salud, que la usar\u00e1 para radiografiar las variedades gen\u00e9ticas de otros microorganismos. Las bases para los laboratorios interesados en inscribirse en el proyecto ya est\u00e1n disponibles en Internet en la p\u00e1gina de la Fapesp (www.fapesp.br<\/a><\/em>).<\/p>\n

La coordinaci\u00f3n del Genoma Virus est\u00e1 a cargo de un comit\u00e9 con miembros de las instituciones participantes del proyecto, que re\u00fane a especialistas en virolog\u00eda, epidemiolog\u00eda y bioinform\u00e1tica: Paolo Zanotto, Marcos Dimas Gubitoso, Edison Luiz Durigon, Eduardo Massad, Jo\u00e3o Renato Rebelo Pinho, Jos\u00e9 Cassis de Moraes, Ester Cerdeira Sabino y Leda Jamal. Tres grandes centrosvan a reunir las investigaciones desarrolladas en la red y tendr\u00e1n la funci\u00f3n de coordinar el trabajo de secuenciamiento y an\u00e1lisis del material gen\u00e9tico de uno o m\u00e1s virus.<\/p>\n

La Fundaci\u00f3n Pro Sangre Hemocentro S\u00e3o Paulo y el Centro de Referencia y Capacitaci\u00f3n en Enfermedades Sexualmente Transmisibles \/SIDA de la Secretar\u00eda de Estado de Salud ser\u00e1n responsables por la coordinaci\u00f3n de los trabajos con el VIH-1. El Instituto de Ciencias Biom\u00e9dicas de la Universidad de S\u00e3o Paulo (ICB- USP) ser\u00e1 el centro de referencia para el VRS, adem\u00e1s de gerenciar toda la parte de bioinform\u00e1tica. El Instituto Adolfo Lutz ser\u00e1 el responsable de la tarea de supervisar el an\u00e1lisis de los dados de dos virus, el HCV y el Hantavirus. El proyecto contar\u00e1 tambi\u00e9n con el apoyo de otras dos unidades de la USP: el Instituto de Matem\u00e1tica se har\u00e1 cargo del soporte computacional y la Facultad de Medicina se ocupar\u00e1 de la parte de inform\u00e1tica m\u00e9dica.<\/p>\n

Importancia
\n<\/strong>\u00bfPor qu\u00e9 es importante estudiar la diversidad gen\u00e9tica de los virus m\u00e1s comunes en S\u00e3o Paulo? \u00bfNo es suficiente analizar los datos producidos en el exterior sobre esos microorganismos y adaptarlos a la realidad del estado o del pa\u00eds? No, con eso no alcanza. Al tratarse de organismos con ADNs inestables, compuestos por genes mutantes y recombinantes (uni\u00f3n de dos o m\u00e1s genes que produce un nuevo y diferente gen), las cepas del VIH-1, HCV, VRS y Hantavirus de mayor incidencia en S\u00e3o Paulo pueden ser muy diferentes a las ya estudiadas fuera del pa\u00eds.<\/p>\n

El caso del agente causante del SIDA sirve bien para graficar la importancia de conocer en sus detalles el perfil gen\u00e9tico de un virus en determinado lugar. Existen dos grandes tipos de virus del SIDA en el mundo, el VIH-1, dominante en Europa y Am\u00e9rica, y el VIH-2, presente sobre todo en \u00c1frica occidental. Cada uno de esos tipos de virus manifiesta comportamientos diferentes en lo que se refiere a una serie de par\u00e1metros, como la velocidad de progresi\u00f3n de la infecci\u00f3n y la respuesta a los tratamientos. Para complicar a\u00fan m\u00e1s las cosas, el VIH-1 se manifiesta bajo la forma de – por lo menosc – nueve subtipos, designados por las letras A, B, C, D, E, F, G, H e I. El VIH-2, por su parte, tiene por lo menos cinco subtipos, tambi\u00e9n nominados con letras (A, B, C, D y E). Como si eso fuera poco, existen tambi\u00e9n variedades raras de virus que tienen pedazos del VIH-1 y del VIH-2 en su estructura gen\u00e9tica.<\/p>\n

Debido a que es aparentemente la variante m\u00e1s encontrada en el mundo, el VIH-1 del subtipo B es usado en muchos tratamientos de enfermos y pruebas de vacunas como virus patr\u00f3n del SIDA. Es all\u00ed que reside el peligro. Al fin de cuentas, no existen datos detallados mostrando si \u00e9se es realmente el virus dominante en todas las \u00e1reas del estado de S\u00e3o Paulo y en Brasil. “Necesitamos entender nuestros virus. Si no lo hacemos, un d\u00eda puede aparecer un laboratorio queriendo, por ejemplo, vender una vacuna para el SIDA basada en una determinada variante del VIH.<\/p>\n

“\u00bfQu\u00e9 haremos entonces, si no dispusi\u00e9ramos de datos sobre los tipos de virus que tenemos ac\u00e1? En una situaci\u00f3n como \u00e9sa, sin informaci\u00f3n sobre la diversidad viral existente en nuestro pa\u00eds, podremos acabar comprando una vacuna que no sirva para nuestros enfermos”, afirma Paolo Zanotto, profesor del ICB-USP y coordinador de bioinform\u00e1tica de la VGDN. Como en el caso del VIH-1, los otros tres virus que son objeto del proyecto tambi\u00e9n presentan varios subtipos conocidos (el HCV tiene por los menos seis variantes identificadas), sin contar las cepas ignoradas.<\/p>\n

Autonom\u00eda
\n<\/strong>Adem\u00e1s de generar datos que redundar\u00e1n en investigaciones en el \u00e1rea de virolog\u00eda, el hecho de contar con una red eficiente y permanente de laboratorios capaces de trazar y monitorear el perfil gen\u00e9tico de los virus tambi\u00e9n aumentar\u00e1 la capacidad de acci\u00f3n del estado. Cuando este funcionando a pleno, la VGDN le otorgar\u00e1 al estado de S\u00e3o Paulo autonom\u00eda internacional y agilidad para efectuar an\u00e1lisis en momentos cr\u00edticos. En medio de una epidemia, por ejemplo, la red puede suministrar una radiograf\u00eda casi en tiempo real de la cepa del virus que est\u00e1 causando el brote. Actualmente existen pocos centros capacitados para llevar a cabo ese tipo de tarea, como el Instituto Adolfo Lutz. Pero falta una red m\u00e1s amplia que coordine, conjugue y, cuando sea necesario, concentre los esfuerzos para lograr objetivos comunes.<\/p>\n

Una red como la VGDN podr\u00eda haber sido muy \u00fatil a la poblaci\u00f3n paulista en 1997. Ese a\u00f1o hubo una epidemia de sarampi\u00f3n que desorient\u00f3 a los infect\u00f3logos brasile\u00f1os y se torn\u00f3 noticia en el mundo. Inexplicablemente, adem\u00e1s de ni\u00f1os, un buen n\u00famero de adultos, algunos vacunados, tambi\u00e9n desarroll\u00f3 la enfermedad. En la \u00e9poca, empleados del CDC (sigla en ingl\u00e9s de Centros de Control de Enfermedades) de Atlanta, Estados Unidos, recogieron muestras del virus que prolifer\u00f3 por aqu\u00ed. Al no ser una prioridad del CDC, que se ocupa fundamentalmente de los problemas de salud de los estadounidenses, los resultados de esos an\u00e1lisis solo estuvieron disponibles mucho tiempo despu\u00e9s, cuando la epidemia ya estaba bajo control.<\/p>\n

Los dato sirvieron para enriquecer los estudios sobre la dolencia, sin lugar a dudas, pero m\u00e1s que nada sirvieron para detener el avance del brote. “Oficialmente, solo fuimos notificados por el CDC sobre el tipo de virus de sarampi\u00f3n de la epidemia en 2000”, afirma Jos\u00e9 C\u00e1ssio. Quiz\u00e1s con un diagn\u00f3stico m\u00e1s r\u00e1pido del tipo de virus que estaba causando la epidemia, los m\u00e9dicos hubieran logrado detenerla en menor tiempo. Y con un costo menor en t\u00e9rminos de personas infectadas y muertes provocadas por la enfermedad.<\/p>\n

Un peque\u00f1o ADN
\n<\/strong>Comparado con el material gen\u00e9tico de otras especies, el ADN de un virus es muy peque\u00f1o. Tiene algunos miles, a veces decenas o centenas de miles de pares de bases, las letras qu\u00edmicas que integran la receta de la vida. En los cuatro tipos de virus que se estudiar\u00e1n, el n\u00famero de pares de bases no supera los 15 mil. Eso quiere decir que, a los efecto de comparar, el genoma de cada uno de esos agentes patol\u00f3gicos es, como m\u00ednimo, 180 veces menor que todo el c\u00f3digo gen\u00e9tico de la bacteria\u00a0Xylella fastidiosa<\/em> que causa la plaga amarilla en los naranjos (2,7 millones de pares de bases), primer organismo secuenciado por el Programa Genoma FAPESP. Si se lo confronta con el tama\u00f1o del ADN humano, es decir, 3 mil millones de pares de bases, el material gen\u00e9tico de los virus cobra aires a\u00fan m\u00e1s \u00ednfimos: tiene 200 mil veces menos letras qu\u00edmicas que el c\u00f3digo gen\u00e9tico del\u00a0Homo sapiens<\/em>.<\/p>\n

En teor\u00eda, por ser min\u00fasculo, el material gen\u00e9tico de los virus no presentar\u00eda gran dificultad para ser secuenciado por completo. En el exterior, varias muestras de ADN de VIH-1, HCV, Hantavirus y VRS ya fueron mapeadas integralmente. Como ya fue dicho, el desaf\u00edo del proyecto no implica solo producir genomas completos de los virus, sino tambi\u00e9n secuenciar y analizar una gran cantidad de muestras de esos agentes patol\u00f3gicos proveniente de todo el estado de S\u00e3o Paulo, con el fin de obtener un panorama general de la diversidad gen\u00e9tica de los virus y establecer cu\u00e1les son las cepas dominantes. Con esa intenci\u00f3n, cada uno de los 17 laboratorios part\u00edcipes del programa generar\u00e1 4.350.000 pares de bases de HCV, 4.180.350 de VIH-1, 1.200.000 de VRS y 180.000 de Hantavirus. En promedia, cada nucle\u00f3tido (par de bases) ser\u00e1 secuenciado cinco veces.<\/p>\n

Cuadro de los virus
\n<\/strong>Los cuatro virus de los cuales la Red de Diversidad de Virus del Estado de S\u00e3o Paulo mapear\u00e1 las variaciones gen\u00e9ticas\u00a0<\/em><\/p>\n

VIH-1
\n<\/strong>Qu\u00e9 es<\/em><\/p>\n

Es el tipo de virus del SIDA m\u00e1s com\u00fan.<\/p>\n

Forma de contagio<\/em>
\nContacto con semeno sangre contaminado con el virus.<\/p>\n

Incidencia<\/em>
\nEn 1999 se registraron 6.538 nuevos casos de la enfermedad y 2.758 muertes en el estado de S\u00e3o Paulo.<\/p>\n

Tama\u00f1o del genoma*<\/em>
\n9.500 pares de bases<\/p>\n

Hantavirus
\n<\/strong>Qu\u00e9 es<\/em><\/p>\n

Es el agente causante de un s\u00edndrome pulmonar caracterizado inicialmente por fiebre, fatiga y dolor muscular, y ensu estadio final, por tosy dificultades respiratorias.<\/p>\n

Forma de transmisi\u00f3n<\/em>
\nPor medio de la inhalaci\u00f3n de part\u00edculas a\u00e9reas de la orina y la saliva de roedores, fundamentalmente salvajes, contaminadas con el virus.<\/p>\n

Incidencia<\/em>
\nDiez personas infectadas y cuatro muertes en 1999 en el estado, seg\u00fan el CVE. Se calcula que por cadacaso de la enfermedad notificado hay 300 no diagnosticados.<\/p>\n

Tama\u00f1o del genoma*<\/em>
\n15 mil pares de bases<\/p>\n

* Tama\u00f1o aproximado, basado en muestras de esos virus cuyas secuencias fueron depositadas en el Genbank, con excepci\u00f3n del Hantavirus<\/p>\n

VRS
\n<\/strong>Qu\u00e9 es<\/em><\/p>\n

El V\u00edrus Respiratorio Sincicial provoca fiebre, secreci\u00f3n nasal, tos y en los casos m\u00e1s graves neumon\u00eda y bronquiolitis (inflamaci\u00f3n de los bronquios).<\/p>\n

Formas de contagio<\/em>
\nPor medio del contacto con gotasde saliva de personas contaminadas,objetos o superficies infectadas.El virus, que est\u00e1 presente en el aire, resiste pocas horas en el medio ambiente.<\/p>\n

Incidencia<\/em>
\nSeg\u00fan el Instituto del Ni\u00f1o, el 90% de los casos de bronquiolitis y el 50% de los de neumon\u00eda en ni\u00f1os de hasta 2 a\u00f1os es causado por el VRS. Ancianos y personas con problemas respiratorios tambi\u00e9n pueden desarrollar esas enfermedades por causa del VRS.<\/p>\n

Tama\u00f1o del genoma*<\/em>
\n15 mil pares de bases<\/p>\n

HCV
\n<\/strong>Qu\u00e9 es<\/em><\/p>\n

Es el virus de la hepatitis C, una de las cinco formas vir\u00f3sicas de la enfermedad, que ataca el h\u00edgado.<\/p>\n

Formas de contagio<\/em>
\nTransfusi\u00f3n de sangre contaminadocon el virus, contacto sexualy transmisi\u00f3n perinatal (de la madre alfeto). Enfermos con problemas cr\u00f3nicos en los ri\u00f1ones que se sometena sesiones frecuentes de hemodi\u00e1lisis corren grandes riesgos de contraer el virus.<\/p>\n

Incidencia<\/em>
\nEl 3% de la poblaci\u00f3n tiene el virus. Como m\u00e1ximo, el 40% de los enfermos respondenal tratamiento disponible.<\/p>\n

Tama\u00f1o del genoma*<\/em>
\n9.500 pares de bases<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"Un proyecto estudiar\u00e1 la gen\u00e9tica de cuatro organismos con alta incidencia en S\u00e3o Paulo","protected":false},"author":6,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[189],"tags":[],"coauthors":[93],"class_list":["post-73270","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-politica-ct"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/73270","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=73270"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/73270\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=73270"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=73270"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=73270"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=73270"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}