Eduardo Geraque<\/p>\n
A lo largo de la historia, las \u00e1reas biol\u00f3gicas presenciaron varias revoluciones, ya sea con las investigaciones de Charles Darwin (1809-1882), en el siglo XIX, o con el descubrimiento de la doble h\u00e9lice hace 50 a\u00f1os. Y muchas de esas novedades revolucionarias se incorporaron a la rutina de los laboratorios que estudiaban la vida. En la d\u00e9cada pasada, antes del que el siglo y el milenio terminasen, surgi\u00f3 una nueva oleada revolucionaria. Los estudios en gen\u00f3mica, que investigaron desde el ADN del hombre hasta el de las bacterias, transformaron para siempre algunas \u00e1reas de la biolog\u00eda. Y en los pr\u00f3ximos a\u00f1os, esas transformaciones se irradiar\u00e1n y afectar\u00e1n a toda la ciencia que gravita alrededor de la biolog\u00eda molecular.<\/p>\n
?Podemos hacer una analog\u00eda entre el momento actual y el de finales de los a\u00f1os 70 y comienzos de los 80?, explica Sandro de Souza, coordinador de Bioinform\u00e1tica del Instituto Ludwig de S\u00e3o Paulo, una entidad ligada al Hospital del C\u00e1ncer. Para este bioinform\u00e1tico, que trabaja en el an\u00e1lisis de secuencias de ADN humano, as\u00ed como hace m\u00e1s de 20 a\u00f1os la biolog\u00eda molecular pas\u00f3 a formar parte de la rutina de casi todos los laboratorios de biolog\u00eda del mundo, lo mismo suceder\u00e1 con la bioinform\u00e1tica en el futuro pr\u00f3ximo. ?Ahora ha habido un cambio cultural.<\/p>\n
En breve, todos los laboratorios van a tener a alguien haciendo alguna investigaci\u00f3n con bioinform\u00e1tica?, dice el cient\u00edfico. Para \u00e9ste, una de las grandes consecuencias del inicio de la era gen\u00f3mica reside en el cambio de visi\u00f3n de los bi\u00f3logos con relaci\u00f3n a las \u00e1reas de estad\u00edstica y de inform\u00e1tica. ?A los bi\u00f3logos no les gustan normalmente esos abordajes m\u00e1s cuantitativos. Pero esa manera de pensar cambi\u00f3 totalmente con los proyectos genomas?, dice Souza. ?El volumen de datos generados y los abordajes posibles de investigaci\u00f3n en el futuro son enormes. La bioinform\u00e1tica, al menos en el \u00e1rea biom\u00e9dica, es un camino sin retorno.?Esa sobrevaloraci\u00f3n de la bioinform\u00e1tica no es exagerada.<\/p>\n
Las herramientas metodol\u00f3gicas desarrolladas por esta \u00e1rea del conocimiento a partir de 1995 fueron esenciales para que los proyectos genomas desarrollados en Brasil y en el mundo tuvieran \u00e9xito. La conclusi\u00f3n del secuenciamiento del genoma humano, por ejemplo, tuvo su plazo reducido en casi cinco a\u00f1os. En Brasil, el grupo de bioinform\u00e1ticos estructurado para integrar la red Onsa (Organization for Nucleotide Sequencing and Analysis) tambi\u00e9n desempe\u00f1\u00f3 un papel decisivo para que el emblem\u00e1tico secuenciamiento de la bacteriaXylella fastidiosa<\/i> (trabajo que mereci\u00f3 la tapa de la revistaNature<\/i> del 13 de julio de 2000) fuese victorioso.<\/p>\n
En el pliego de convocaci\u00f3n para el proyecto de laXylella<\/i> hab\u00eda una vacante para un laboratorio de bioinform\u00e1tica. La Unicamp acab\u00f3 siendo la vencedora. Al frente del laboratorio de bioinform\u00e1tica de dicha instituci\u00f3n estaban los j\u00f3venes Jo\u00e3o Setubal y Jo\u00e3o Meidanis. Otro Jo\u00e3o, Kitajima, tambi\u00e9n integraba el equipo. No se trataba apenas de recibir los pedazos de ADN secuenciados, ponerlos en la computadora y listo. Adem\u00e1s de afinar las t\u00e9cnicas metodol\u00f3gicas, los apenas profesionales inform\u00e1ticos de aquel tiempo tuvieron tambi\u00e9n que acercar su rutinas de trabajo a las de los bi\u00f3logos moleculares.<\/p>\n
Esta nueva rutina en la que se transform\u00f3 la vida de los cient\u00edficos de la inform\u00e1tica que participaron en el Proyecto Genoma tambi\u00e9n de hizo efectiva \u00fanicamente porque hubo coraje cient\u00edfico. Si dependiera de uno de los consultores internacionales escogidos por la FAPESP para integrar el comit\u00e9 cient\u00edfico internacional del proyecto de laXylella<\/i> , todos los trabajos de bioinform\u00e1tica habr\u00edan sido elaborados en el exterior. Para Andr\u00e9 Goffeau -el cient\u00edfico franc\u00e9s que coordin\u00f3 el secuenciamiento del genoma de la levadura, concluido en 1996-, en aquella \u00e9poca habr\u00eda sido mejor contratar a un experto europeo para encargarse de la bioinform\u00e1tica del secuenciamiento de laXylella<\/i> . Goffeau conoc\u00eda a varios; al fin y al cabo, el proyecto de la levadura hab\u00eda congregado a 100 laboratorios europeos. Una vez m\u00e1s, los l\u00edderes brasile\u00f1os resolvieron confiar en la mano de obra nacional, y no se arrepintieron. Hasta Goffeau acab\u00f3 reconociendo el m\u00e9rito de Brasil en el \u00e1rea, por ocasi\u00f3n de la conclusi\u00f3n del proyecto en 2000.<\/p>\n
Toda esa revoluci\u00f3n causada por el inicio de la era gen\u00f3mica, en la cual Brasil tuvo un papel fundamental, al menos en el caso de los proyectos del \u00e1rea agr\u00edcola, est\u00e1 mucho m\u00e1s cerca del comienzo que del final. Es como si la oceanograf\u00eda hubiera conseguido estudiar hasta hoy apenas los 10 primeros metros de la columna de agua del oc\u00e9ano. ?Si imagin\u00e1ramos una pir\u00e1mide invertida, el secuenciamiento del ADN y de las prote\u00ednas se encuentra reci\u00e9n en la punta inferior de esa figura?, dice Jo\u00e3o Setubal, del Instituto de Computaci\u00f3n de la Unicamp. Pese a que dentro de esa misma fase existen a\u00fan algunos problemas metodol\u00f3gicos, debido muchas veces a la complejidad del objeto estudiado, como es el caso del genoma humano, una nueva fase dentro de la bioinform\u00e1tica se encuentra en marcha. ?Al caminar hacia el tope de esa pir\u00e1mide invertida, un segundo estadio es el estudio de la interacci\u00f3n entre las mol\u00e9culas de una misma c\u00e9lula?, dice Setubal. Las investigaciones conocidas como ?estudiodelproteoma? se insertan en ese tramo de la hipot\u00e9tica pir\u00e1mide invertida de la bioinform\u00e1tica. ?Bajo ninguna hip\u00f3tesis las nuevas herramientas y las nuevas t\u00e9cnicas de la bioinform\u00e1tica excluyen a las antiguas. Estas novedades marchan juntas. Lo nuevo no le quita importancia a lo antiguo?, dice el cient\u00edfico de la Unicamp.<\/p>\n
En esta evoluci\u00f3n constante de la bioinform\u00e1tica y la gen\u00f3mica, la interacci\u00f3n entre bi\u00f3logos e inform\u00e1ticos, tal como lo demostraron los proyectos desarrollados por la red Onsa, parece ser un atajo para arribar a nuevos descubrimientos. ?Las nuevas herramientas dependen de un intenso y fluido entre las \u00e1reas de computaci\u00f3n y biolog\u00eda, e involucran al m\u00e1ximo a los investigadores?, dice Jo\u00e3o Meidanis, de la Unicamp. El cient\u00edfico, que al margen de continuar en la universidad tambi\u00e9n act\u00faa en su propia empresa de bioinform\u00e1tica -Scylla-, se vale una vez m\u00e1s de las ense\u00f1anzas de los primeros proyectos de secuenciamiento gen\u00e9tico para analizar el momento actual.<\/p>\n
?En el laboratorio de bioinform\u00e1tica de la Unicamp, durante la realizaci\u00f3n de los proyectos genoma, pon\u00edamos la mano en la masa de verdad con los colegas bi\u00f3logos. No todos los investigadores nuevos, que ingresaron en el\u00e1rea m\u00e1s recientemente, ponen \u00e9nfasis en esa relaci\u00f3n m\u00e1s estrecha. Los bi\u00f3logos se resienten?. La ?otra cara de la moneda?, como dice Meidanis, tambi\u00e9n existe. ?Algunos dicen que nosotros ?malacostumbramos? a los bi\u00f3logos, pues les dimos todo servido en bandeja. Y ahora se ha generado un clima que sugiere que eso es efectivamente gratuito?.<\/p>\n
Pese a esa falta de armon\u00eda en algunos casos, el propio cient\u00edfico de Scylla reconoce que se est\u00e1n creando nuevas herramientas de bioinform\u00e1tica. ?El Proyecto Cage (Cooperation for Analysis of Gene Expression), del Instituto de Qu\u00edmica de la USP, ha presentado algunos resultados interesantes.?Hasta llegar a la base -que a decir verdad ser\u00eda la c\u00faspide del proceso- de la pir\u00e1mide planteada por Setubal, deber\u00e1n superarse otros cinco niveles. Esto demuestra \u00fanicamente que el camino que deben seguir tanto los bioinform\u00e1ticos como los bi\u00f3logos moleculares es a\u00fan infinitamente largo. ?Estamos entrando ahora en la fase del estudio del funcionamiento de las estructuras dentro de una misma c\u00e9lula?, explica Set\u00fabal.<\/p>\n
La evoluci\u00f3n natural de las investigaciones llegar\u00e1 luego al an\u00e1lisis de las c\u00e9lulas de un tejido o de un \u00f3rgano, antes de tener como objeto de estudio al individuo completo. Y despu\u00e9s, contin\u00faa Setubal, habr\u00e1 una demanda para que las poblaciones y la bi\u00f3sfera en su totalidad sean investigadas por la gen\u00f3mica. Posiblemente, cuando ese futuro lejano llegue, habr\u00e1 alguien que utilizar\u00e1 el t\u00e9rmino biolog\u00eda de sistemas computacionales para reemplazar a aquello que hoy en d\u00eda se ha dado en llamar de bioinform\u00e1tica.<\/p>\n
Este camino ha presentado y continuar\u00e1 presentando muchos obst\u00e1culos. Pese a que el secuenciamiento gen\u00e9tico se ha convertido en una rutina en varios laboratorios de S\u00e3o Paulo y de Brasil, pasadas las inmensas dificultades de los procesos iniciales, algunas limitaciones metodol\u00f3gicas a\u00fan no han sido sorteadas, incluso a nivel mundial. ?El secuenciamiento del genoma humano, por ejemplo, est\u00e1 listo. Pero no se sabe con seguridad cu\u00e1ntos genes tiene. Fue posible tan solo llegar a una aproximaci\u00f3n de 30 mil?, dice Setubal. Aun faltando esa informaci\u00f3n, los datos generados por el secuenciamiento del ADN del hombre pueden usarse para que la investigaci\u00f3n gen\u00f3mica avance.<\/p>\n
?Este problema del n\u00famero de genes se produce porque el genoma humano es bastante complejo. Pese a todas las t\u00e9cnicas eficientes que tenemos hoy, no es nada sencillo hallar esos genes?, explica Sandro de Souza, cient\u00edfico que tiene en su curr\u00edculum la participaci\u00f3n en la invenci\u00f3n del m\u00e9todo Orestes (Open Reading frames EST Sequences) de secuenciamiento gen\u00e9tico. Debido precisamente a esas otras formas de an\u00e1lisis de los tramos de ADN, y pese a no conocerse el n\u00famero correcto de genes del ser humano, este trabajo de secuenciamiento gen\u00e9tico no solamente deton\u00f3 la revoluci\u00f3n gen\u00f3mica de los a\u00f1os 90, sino que tambi\u00e9n mostr\u00f3 tener una utilidad muy grande para el propio hombre.<\/p>\n
Los signos dentro del territorio brasile\u00f1o de que esa revoluci\u00f3n est\u00e1 consolidada son los centros de bioinform\u00e1tica que est\u00e1n form\u00e1ndose en varias regiones del pa\u00eds. Seg\u00fan Meidanis, al margen de los ya tradicionales polos de investigaci\u00f3n paulistas (Unicamp, USP, Unesp e Instituto Ludwig), pueden mencionarse nuevos centros. ?Se formando gente en varios puntos. Tambi\u00e9n se han creado carreras de posgrado, y en algunos lugares, nuevos n\u00facleos, como el del LNCC (Laboratorio Nacional de Computaci\u00f3n Cient\u00edfica de Petr\u00f3polis, R\u00edo de Janeiro), el de la UFRGS, el de la UFPE y el de la UFMG.<\/p>\n
En el mes de mayo, la realizaci\u00f3n del Primer Congreso Brasile\u00f1o de Bioinform\u00e1tica ser\u00e1 una importante oportunidad para que los cient\u00edficos del \u00e1rea actualicen sus conocimientos, y los resultados de este segmento en el pa\u00eds.La gran demanda de profesionales de la bioinform\u00e1tica es un indicador que por s\u00ed solo muestra el aumento de proyectos en el \u00e1rea. Si bien el problema en algunos lugares reside actualmente en la falta de personal para ense\u00f1ar estas novedades, en el futuro pr\u00f3ximo otra cuesti\u00f3n diferente podr\u00e1 tener que resolverse. Acomodar a todos estos bioinform\u00e1ticos podr\u00eda ser uno de los desaf\u00edos en breve. Uno de los caminos para resolver este problema ya han comenzado desandarlo los mismos cient\u00edficos que desarrollaron el \u00e1rea en Brasil.<\/p>\n
Mientras Setubal, que ayud\u00f3 en la fundaci\u00f3n de la empresa de biotecnolog\u00eda Alellyx, ha vuelto ahora a dedicarse exclusivamente a la universidad, Meidanis contin\u00faa anhelando alcanzar sus objetivos tambi\u00e9n en el terreno de la iniciativa privada. ?Creemos que toda la sociedad se beneficiar\u00e1 con la transmisi\u00f3n del gran conocimiento generado en los proyectos genomas para las empresas. Pero la lucha es ardua. Primeramente porque es una novedad, y segundo porque muchas empresas del \u00e1rea que act\u00faan en Brasil son multinacionales, y ejecutan sus investigaciones afuera?, dice Meidanis. Para el investigador, las pocas empresas que resuelven invertir en este campo deben aliarse en el proceso por el cual la ciencia procura indirectamente dar impulso a la econom\u00eda nacional.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"Durante los pr","protected":false},"author":0,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[151],"tags":[],"coauthors":[],"class_list":["post-76578","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-sem-categoria-es-es"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/76578","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=76578"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/76578\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=76578"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=76578"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=76578"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=76578"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}