Luego de recibir un impulso de desarrollo con los proyectos genomas, que se propagaron por el mundo y por Brasil, la bioinform\u00e1tica empieza ahora destacarse como una importante \u00e1rea para la generaci\u00f3n de innovaci\u00f3n tecnol\u00f3gica. Uno de estos frutos originados en la investigaci\u00f3n gen\u00f3mica es un software producido por la empresa Scylla, de Campinas, para el Instituto de Psiquiatr\u00eda de la Universidad de S\u00e3o Paulo (USP). Es un sistema de identificaci\u00f3n de diferencias gen\u00e9ticas denominadas polimorfismos en la secuencias de bases qu\u00edmicas que forman los genes, las famosas adenina, citosina, timina y guanina, tambi\u00e9n conocidas como nucle\u00f3tidos. Una secuencia o tan solo una letra diferenciada -indicativa de la existencia de una de estas sustancias en determinado gen- puede derivar en una predisposici\u00f3n para contraer enfermedades mentales, por ejemplo.<\/p>\n
Este software, denominado Sistema de Identificaci\u00f3n de Polimorfismos (SIP), servir\u00e1 para que los investigadores de la USP puedan identificar con mayor facilidad tales diferencias, para luego compararlas con la condici\u00f3n f\u00edsica de la persona analizada, relacionando el polimorfismo con la enfermedad. “El SIP constituye una herramienta para verificar los polimorfismos de nucle\u00f3tidos \u00fanicos, o SNPs, existentes en el ADN. La gran mayor\u00eda de las personas tiene siempre una secuencia, como por ejemplo ATTGCATG.<\/p>\n
En caso de que encontr\u00e1semos en ese mismo gen (en otra persona) la secuencia ATTGCTTG, es decir, un intercambio de A por T, primeramente se verificar\u00eda si hay alg\u00fan error en el proceso de obtenci\u00f3n de los datos. De persistir la diferencia, se comparar\u00eda con la condici\u00f3n m\u00e9dica de la persona”, explica el profesor Jo\u00e3o Meidanis, del Departamento de Teor\u00eda de la Computaci\u00f3n del Instituto de Computaci\u00f3n de la Universidad Estadual de Campinas (Unicamp) y fundador de Scylla. Hay dos ex alumnos de Meidanis en calidad de socios en la empresa: Alexandre Corr\u00eaa Barbosa y Zanoni Dias. Todos ellos fundaron la empresa Scylla en 2002, tras un largo per\u00edodo como participantes del \u00e1rea de bioinform\u00e1tica de los proyectos genomas de las bacterias\u00a0Xyllela fastidiosa<\/em> y\u00a0Xanthomonas citri<\/em> y de la ca\u00f1a de az\u00facar, de los cuales Meidanis fue uno de los coordinadores.<\/p>\n Banco mundial “Estas informaciones ser\u00e1n \u00fatiles para estudiar a un grupo de 500 personas, 250 de \u00e9stas con esquizofrenia y 250 en calidad de grupo de control sin la enfermedad. As\u00ed, verificamos las diferencias en las bases y las relacionamos con una enfermedad”, explica Dias Neto. “Buscamos tambi\u00e9n polimorfismos que puedan significar resistencia a medicamentos. Los SNPs pueden ser responsables de la ineficacia de determinadas drogas en algunas personas.”<\/p>\n La s\u00edntesis de una prote\u00edna alterada, causada por un determinado SNP, puede influir sobre las conexiones qu\u00edmicas que hacen que el medicamento sea eficiente. “Existen individuos que responden al litio (una sustancia utilizada contra la depresi\u00f3n<\/em>) y otros no. Pretendemos entender y caracterizar a los genes ligados a estas respuestas cl\u00ednicas”, dice Dias Neto. As\u00ed, el software desarrollado por Scylla podr\u00e1 tambi\u00e9n ser de utilidad en otros centros de investigaci\u00f3n y laboratorios, y en el \u00e1rea de la industria farmac\u00e9utica.<\/p>\n Clientes en red
\n<\/strong>Si se tiene en cuenta tan solo el Genoma Humano, se conocen m\u00e1s de 4 millones de SNPs. \u00c9stos son identificados como tal si est\u00e1n presentes en el 1% de la poblaci\u00f3n. El conocimiento sobre los SNPs est\u00e1 registrado en bancos mundiales de polimorfismos, a los cuales, con la ayuda del software, el equipo coordinado por el profesor Emmanuel Dias Neto, del Laboratorio de Neurociencias del Instituto de Psiquiatr\u00eda del Hospital de Cl\u00ednicas de la USP ingresar\u00e1 para identificar y clasificar a los SNPs.<\/p>\n
\n<\/strong>En t\u00e9rminos pr\u00e1cticos, el software posee un servidor que permite la participaci\u00f3n de varios clientes. \u00c9stos pueden de esta manera hace funcionar el programa en red local o no, en ambiente Linux o Windows. El SIP es el primero producto comercial de Scylla, una empresa que recibi\u00f3 inversiones financieras de Votorantim Ventures, brazo para capital de riesgo del Grupo Votorantim.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"El an\u00e1lisis de las alteraciones en los nucle\u00f3tidos es el tema del software","protected":false},"author":10,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[192],"tags":[],"coauthors":[97],"class_list":["post-76661","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-tecnologia-es"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/76661","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/10"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=76661"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/76661\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=76661"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=76661"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=76661"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/es\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=76661"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}