{"id":161658,"date":"2014-01-21T13:20:44","date_gmt":"2014-01-21T15:20:44","guid":{"rendered":"http:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/?p=161658"},"modified":"2015-01-21T14:34:11","modified_gmt":"2015-01-21T16:34:11","slug":"ramifications-de-la-canne-a-sucre","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/ramifications-de-la-canne-a-sucre\/","title":{"rendered":"Ramifications de la canne \u00e0 sucre"},"content":{"rendered":"

Publi\u00e9 en juin 2013<\/em><\/p>\n

\"\"<\/a>La canne \u00e0 sucre ne se cultive pas uniquement avec des semences mais avec des morceaux de chaume constitu\u00e9s de tiges de canne \u00e0 sucre. Chaque fragment g\u00e8re une nouvelle plante gr\u00e2ce au d\u00e9veloppement de bourgeons lat\u00e9raux. La g\u00e9n\u00e9tique de cette architecture de la canne est en train d\u2019\u00eatre d\u00e9voil\u00e9e par l\u2019\u00e9quipe de l\u2019ing\u00e9nieur agronome Fabio Nogueira, de l\u2019Universit\u00e9 Publique Pauliste (Unesp) de Botucatu, en partenariat avec le bioinformaticien Renato Vicentini, de l\u2019Universit\u00e9 Publique de Campinas. Dans un article publi\u00e9 en mai dans le Journal of Experimental Botany<\/em>, les chercheurs ont montr\u00e9 que de petites mol\u00e9cules d\u2019ARNs contr\u00f4laient l\u2019inactivation et l\u2019activation des g\u00e8nes de ces bourgeons lat\u00e9raux appel\u00e9s gemmes axillaires.<\/p>\n

\u00abChaque m\u00e9rithalle de la tige poss\u00e8de un ou deux gemmes axillaire en sommeil\u00bb, explique Fabio Nogueira. \u00abLe fait de couper la tige entraine une modification du bilan hormonal et m\u00e9tabolique, induit la croissance du gemme et produit une nouvelle plante. \u00abLes principaux acteurs sont des mol\u00e9cules d\u2019ARN qui agissent comme des interrupteurs sur les g\u00e8nes. Le micro ARN 159 en est un exemple et il se trouve en grande quantit\u00e9 dans les gemmes axillaires en sommeil, \u00e9galement caract\u00e9ris\u00e9s pour leur teneur \u00e9lev\u00e9e en une hormone v\u00e9g\u00e9tale appel\u00e9e acide abscissique. Cet ARN bloque la r\u00e9ponse physiologique d\u2019une autre hormone, l\u2019acide gibb\u00e9rellique, qui stimule la prolif\u00e9ration cellulaire. Quand la plante est coup\u00e9e, un signal encore non identifi\u00e9 r\u00e9duit la quantit\u00e9 d\u2019acide abscissique dans les gemmes axillaires, limitant l\u2019action de ce micro-ARN et lib\u00e9rant la voie de signalisation de l\u2019acide gibb\u00e9rellique.<\/p>\n

L\u2019origine de ces nombreux micro- ARNs qui agissent dans la signalisation hormonale et dans les r\u00e9ponses \u00e0 des situations de stress, comme la r\u00e9sistance \u00e0 la s\u00e8cheresse, semble se trouver dans des fragments mobiles d\u2019ADN, appel\u00e9s \u00e9l\u00e9ments de transposition. Fabio Nogueira est arriv\u00e9 \u00e0 cette conclusion en comparant les s\u00e9quences d\u2019ARN d\u00e9tect\u00e9es dans son projet avec la banque de donn\u00e9es produite par le groupe de la biologiste de l\u2019Universit\u00e9 de S\u00e3o Paulo (USP) Marie-Anne Van Sluys. D\u2019apr\u00e8s lui, les \u00e9l\u00e9ments de transposition associ\u00e9s aux petits ARNs favorisent l\u2019accroissement de la diversit\u00e9 et le contr\u00f4le du fonctionnement du g\u00e9nome. La relation entre les deux entit\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiques ne s\u2019arr\u00eate pas l\u00e0. \u00ab Certains \u00e9l\u00e9ments de transposition sont r\u00e9gul\u00e9s n\u00e9gativement par de petits ARNs, qui fonctionnent comme un tampon \u00e9vitant les modifications de l\u2019ADN\u00bb, d\u00e9clare Fabio Nogueira. Dans le cas de la canne \u00e0 sucre, le fait d\u2019\u00e9viter les modifications de l\u2019ADN est important pour conserver les propri\u00e9t\u00e9s des vari\u00e9t\u00e9s commerciales d\u00e9velopp\u00e9es pour produire davantage de sucre ou pour \u00eatre cultiv\u00e9es dans des zones peu pluvieuses.<\/p>\n

\u00abAvec ce projet, j\u2019ai cherch\u00e9 \u00e0 d\u00e9velopper une connaissance de base, mais cette compr\u00e9hension sera \u00e9galement essentielle pour la propagation et la productivit\u00e9 de la canne \u00e0 sucre\u00bb, d\u00e9clare Fabio Nogueira. L\u2019architecture de la plante est primordiale pour d\u00e9terminer l\u2019usage que l\u2019on pr\u00e9tend en faire. Des tiges peu ramifi\u00e9es sont meilleures pour produire du sucre, et des plantes poss\u00e9dant davantage de bourgeons lat\u00e9raux et de feuilles fournissent la biomasse qui est la mati\u00e8re premi\u00e8re destin\u00e9e \u00e0 fabriquer l\u2019\u00e9thanol de deuxi\u00e8me g\u00e9n\u00e9ration. Conna\u00eetre les acteurs g\u00e9n\u00e9tiques \u00e0 l\u2019origine de ces caract\u00e9ristiques permet de d\u00e9velopper des marqueurs destin\u00e9s \u00e0 la s\u00e9lection de pousses et peut contribuer \u00e0 l\u2019am\u00e9lioration des vari\u00e9t\u00e9s commerciales. L\u2019importance de ce travail a \u00e9t\u00e9 r\u00e9compens\u00e9e par la deuxi\u00e8me place du prix Top \u00c9thanol en 2012 dans la cat\u00e9gorie travaux acad\u00e9miques pour le m\u00e9moire de master de Fausto Ortiz-Morea, et qui a \u00e9t\u00e9 r\u00e9cemment publi\u00e9. Un autre article de l\u2019\u00e9quipe de Fabio Nogueira, publi\u00e9 en 2010 dans la revue BMC Plant Biology<\/em>, \u00e0 \u00e9galement remport\u00e9 la deuxi\u00e8me place dans ce m\u00eame prix.<\/p>\n

Le travail de Fabio Nogueira s\u2019est concr\u00e9tis\u00e9 par la publication d\u2019un catalogue de micro-ARNs actifs (micro transcriptomique) sur les gemmes axillaires de la canne \u00e0 sucre, et qui a \u00e9t\u00e9 mis \u00e0 la disposition d\u2019autres chercheurs. Il est en train de tester certains de ces ARNs sur des plantes utilis\u00e9es comme mod\u00e8les v\u00e9g\u00e9taux afin de v\u00e9rifier leurs effets sur le m\u00e9tabolisme, en collaboration avec une \u00e9quipe de l\u2019\u00c9cole Sup\u00e9rieure d\u2019Agriculture Luiz de Queiroz (Esalq), de l\u2019USP.<\/p>\n

Le chercheur est heureux d\u2019\u00eatre le premier \u00e0 diss\u00e9quer la r\u00e9gulation g\u00e9nique de l\u2019architecture de la canne \u00e0 sucre, mais ces recherches vont encore plus loin. Il n\u2019y a jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent aucune \u00e9tude men\u00e9e sur d\u2019autres plantes en ce qui concerne l\u2019activit\u00e9 des micro- ARNs sur les gemmes axillaires car ces structures sont tr\u00e8s petites et difficiles \u00e0 isoler. La canne \u00e0 sucre, gr\u00e2ce \u00e0 ses gemmes visibles \u00e0 l\u2019\u0153il nu qui permettent de mesurer les concentrations hormonales et extraire l\u2019ADN et l\u2019ARN, a tout pour devenir un organisme mod\u00e8le pour les \u00e9tudes de l\u2019architecture v\u00e9g\u00e9tale.<\/p>\n

Projet<\/strong>
\nIsolation et caract\u00e9risation de micro-ARNs et de leurs g\u00e8nes cibles sur la canne \u00e0 sucre (n\u00ba 2007\/58289-5<\/a>); Modalit\u00e9<\/strong> Programme Jeune Chercheur; Coordination<\/strong>. Fabio Tebaldi Silveira Nogueira \u2013 IB\/Unesp; Investissement<\/strong>\u00a0314 903,10 de reais (FAPESP).<\/p>\n

Article Scientifique<\/em>
\nORTIZ-MOREA, F.A. et al<\/em>. Global analysis of the sugarcane microtranscriptome reveals a unique composition of small RNAs associated with axillary bud outgrowth<\/a>. Journal of Experimental Botany<\/strong>. v. 64, n. 8, p. 2.307-20. mai. 2013.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"L\u2019ARN contr\u00f4le la croissance \u2028des rameaux lat\u00e9raux de la canne \u00e0 sucre","protected":false},"author":3,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[1180],"tags":[],"coauthors":[95],"class_list":["post-161658","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-sciences"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/161658","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=161658"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/161658\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=161658"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=161658"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=161658"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/revistapesquisa.fapesp.br\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=161658"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}