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Estratégias

Para entender a genômica

A edição de 30 de setembro da revistaNature trazuma advertência sobre a dificuldade que biólogos e cientistas de áreas correlatas vêm tendo de acompanhar os avanços científicos no campo da genética e da genômica, devido à falta de uma nomenclatura comum. Seqüências completasde genes, segundo a revista, podem ser obtidas, empoucas horas, diante de um computador, e os genes, os produtos e as funções de suas proteínas e seus equivalentes em outras espécies (homólogose ortólogos) estão sendonomeados, identificadose publicados numa velocidade espantosa.

Um efeito colateral disso é, de acordo com a Nature,o crescente caos nanomenclatura. “Uma única proteína é estudada, muitas vezes simultaneamente, por vários laboratórios independentes, cada um usando seu próprio apelido e recusando-sea reconhecer outros nomes ou acatar um único rótulo. Isso causa problemas inevitáveis aos que precisam acompanhara literatura.” Há tentativas para encontrar solução para o problema, mas a velocidade com que os genes estão sendo identificados supera a velocidade de qualquer estratégia de nomeação consolidada em curso.

Outras fontes de confusão são os muitos nomes e funções dos genes ou proteínas descritos. A sugestão é que, ao descrever um gene ou proteína, os pesquisadores declarem todos os outros nomes e funções a eles associados. E ao submeter um trabalho a qualquer publicação, descrevendo um novo gene com uma função determinada, os autores informem a literatura já existente sobre um orto/homólogo. Para a Nature, um papel muito importante pode ser realizado pelos que administram bases de dados, já que elas deveriam estar em posição de detectar novas entradas e insistir na conformidade com um sistema de nomenclatura, como condição de registro.

Com um processo desse tipo funcionando,as publicações poderiam exigir o registro prévio como condição de publicação. “De sua parte, Nature vai ser, doravante, mais rigorosa na exigência de que os autores de trabalhos que descrevem a função de uma proteína também declarem todos os outros nomes conhecidos daquela proteína na primeira vez que ela for mencionada no texto”, anuncia a publicação.

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