El gobernador de São Paulo, José Serra, nombró el día 22 de noviembre al nuevo vicepresidente y a los directivos de la FAPESP para los próximos tres años. Los nombres fueron escogidos a partir de ternas escogidas por el Consejo Superior de la FAPESP. Ricardo Renzo Brentani fue nombrado director presidente, reelecto partir del término de su mandato, en diciembre. Profesor titular de la Facultad de Medicina de la Universidad de São Paulo (USP), es director presidente del Hospital del Cáncer A.C. Camargo y ex coordinador del Centro Antonio Prudente para Investigación y Tratamiento del Cáncer. Digirió el Instituto Ludwig de Investigaciones sobre el Cáncer. Carlos Henrique de Brito Cruz fue nombrado para el cargo de director científico de la FAPESP, también en reelección a partir del término de su mandato, en abril. Profesor titular del Instituto de Física Gleb Wataghin de la Universidad Estadual de Campinas (Unicamp), fue presidente de la FAPESP de 1996 a 2002 y rector de la Unicamp de 2002 a 2005. Joaquim José de Camargo Engler ejercerá la función de director administrativo, en reelección a partir de febrero, cuando termina su actual mandato. Profesor titular del Departamento de Economía, Administración y Sociología de la Escuela Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq) de la USP y presidente de la Comisión de Presupuesto y Patrimonio de la USP, Engler fue director de la Esalq, director del Centro de Energía Nuclear en la Agricultura (Cena) y jefe de gabinete del rector de la USP. El consejero José Arana Varela va a ejercer la función de vicepresidente de la Fundación. Profesor titular del Instituto de Química de la Universidad Estadual Paulista (Unesp) de Araraquara, Varela fue director de la Asociación Brasileña de Cerámica, de la Asociación Brasileña de Metalurgia y Materiales y de la Sociedad Brasileña de Materiales.
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